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如何过滤掉表达丰度低的基因？比如原始表达值小于10，超过25%样...
假设表达矩阵data,行为基因，列为样本，则代码如下： data=data[which(apply(data,1,function(x){return(sum(x>10))})>ncol(data)*0.25),]
回答于 2019-02-18 20:21
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WGCNA分析和TNM分期以及其他分类变量关联，变量类型不止2个，该...
T1,T2，T3,T4可以分别做四个0,1的变量来处理，也可以做1,2,3,4来处理
回答于 2019-02-18 20:17
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甲基化的合并文件，只合并了每个样本的beta value,可否合并TSS p...
每个CpG位点对应TSS 都是固定的，没必要合并，你随便找一个没有合并的甲基化谱文件里面就有这个对应的信息
回答于 2019-02-18 20:16
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请问如何向NCBI 提交自己的测序数据？
这个网上教程很多，看这里： http://weixin.shengxin.ren/web/wei_xin/examples/Html/10000/13151.html http://api.sangerbox.com/weixin.html?word=NCBI%2B%E6%8F%90%E4%BA%A4%E8%87%AA%E5%B7%B1%E7%9A%84%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E6%95%B0%E6%8D%AE&page=0&ToUserName=gh_2dc29180a56b&sort=0&MAXpage=10
回答于 2019-01-23 12:03
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从TCGA中下载的RNAseq里样本名字和clinical样本名字不对应怎么解...
这是因为 clinical名称只是病人的ID,RNASeq的名称后面多了三位数表示哪种组织，比如-01表示tumor，-10表示normal； 所以 随访信息的单位是 病人，RNASeq的单位是病人的某个组织，ID肯定是不同的，你自己需要做一下变换
回答于 2019-01-23 11:58