祝让飞的回答

祝让飞 - 生物信息工程师生信一期

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1139 个回答

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老版本已无法使用，你可以用最新版的V14 下载地址：http://sangerbox.com

回答于 2018-08-23 10:58

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你可以看 R 的survival包里面的coxph函数，原理一样

回答于 2018-08-23 10:57

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做combat之前不要做分位数标准化，因为这样会将原有的批次差异一个掩盖掉以至于combat无法分析

回答于 2018-08-23 10:56

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三张PPT 告诉你如何取舍

回答于 2018-08-23 10:54

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不知道微信上找我的是不是你，我顺手写了一个教程，你且看一下： https://shengxin.ren/article/421

回答于 2018-08-22 14:32

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这是一句赋值语句就是让RNAseq_voom 等于 fpkm

回答于 2018-08-22 14:26

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ensemble号是不支持的，你选择转成genesymbol

回答于 2018-08-22 14:21

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这警告就是你有些数据超出了极限值，即无穷大，可以不用管会自动过滤掉

回答于 2018-08-22 14:20

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给你个例子： expro=read.csv(ePath,sep = '\t',row.names = 1,stringsAsFactors = F,check.names = F) 重点注意：check.names = F

回答于 2018-08-20 17:58

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KM和Cox是两种不同的方法，KM是需要分组的，而Cox支持连续型变量，对于检验方法也有不同KM是非参数法，Cox是半参数法，故存在不同也是正常现象，KM如何分组对结果影响很大，你可以多尝试几种分组方法

回答于 2018-08-19 14:34