祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

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请问DEcenter出来的数据Top_exp数量有限制,想要所有的差异基因...

应该是你的数据出了文件,你检查一下生成的gct文件有多少行,有没有非数字的值之类的,另外检查一下你的结果保存目录最好不要有特殊字符比如空格,斜杠之类的, 画热图 使用row-zscore和非zscore都可以的,只是好看难看一点罢了

回答于 2018-06-02 17:22

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请问无法分配矢量是什么意思?

就是电脑内存不足

回答于 2018-06-02 17:18

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请问GSE74513,芯片转换的时候始终报数据格式错误,不能导出样本...

部分芯片转换有问题,新版已修复,在新版工具盒(SangerBox)里可以使用

回答于 2018-05-31 22:23

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GSEA运行一般要等多久?

一般不会太久,大概五到十分钟算久了

回答于 2018-05-31 22:17

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论文方法部分中该如何描述使用TCGA下载工具下载RNA-Seq的数据呢...

download form gdc-api,然后加上下载日期和你的数据类型及描述即可

回答于 2018-05-31 22:01

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firebrowse中TCGA数据下载文件名的意义?

illuminahiseq_rnaseqv2-RSEM_genes_normalized  (MD5)  illuminahiseq_rnaseqv2-RSEM_genes  (MD5) 这两个都行

回答于 2018-05-31 21:44

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GEO芯片中不同研究但同一平台下的cel文件可以直接横向合并吗?

可以横向合并,用这个工具:https://www.shengxin.ren/article/304

回答于 2018-05-31 21:42

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TCGA下载工具 下载不了了

检查一下你那边网络是否能够上TCGA

回答于 2018-05-31 21:38

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sanger工具盒内的软件打不开

检查一下电脑里的是否安装了java,如图:

回答于 2018-05-29 11:42