祝让飞的回答

祝让飞 - 生物信息工程师生信一期

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1139 个回答

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自己用R中的字符串操作转换一下撒

回答于 2018-05-08 19:16

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应该是有多种类型如：Normal，del(5q) / 5q-，del(7q) / 7q-

回答于 2018-05-08 19:15

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应该是缺少相关的python包，可以使用工具盒中的下载工具V10

回答于 2018-05-08 19:14

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和TCGA的去对应就好了

回答于 2018-05-08 19:11

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差异的阈值卡的比较严，你放宽阈值试试

回答于 2018-05-08 19:10

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表达数据肯定是一样的，因为测序只测一次，但随访数据会一直随访，也就是会更新，最近TCGA对随访数据做了更新，会有版本差别，他的API和官网并没有及时同步以至于下载工具与官网出现版本差异，看你自己的选择

回答于 2018-05-08 19:09

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使用TCGA的数据去验证你目前的结果，做一下差异对比，如果一致就可以了。

回答于 2018-05-08 19:06

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根据文件自己用Excel再卡一下阈值就好

回答于 2018-05-08 19:05

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可以的，把位点做成矩阵就可以

回答于 2018-05-08 19:04

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new_tumor_event_after_initial_treatment 这个对应应该还有一个时间，如果有的话就是术后复发，person_neoplasm_cancer_status可能没更新过来

回答于 2018-05-08 18:54