祝让飞的回答

祝让飞 - 生物信息工程师生信一期

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请问下载的TCGA肺癌的数据是什么时候的？是2015年的？

一般情况下大部分的RNA-Seq数据近两年更新不多，临床随访信息在一直更新

回答于 2018-05-21 15:41

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DEcenter运行后提示“数据表中样品列有重复” 怎么破？

就是数据的行名有重复，你检查一下你的数据，用文本打开看看

回答于 2018-05-21 15:40

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关于批量生存工具的一些改进建议

感谢您的建议，我们正在专研优化这个过程，在六月份之前会有全新的版本

回答于 2018-05-21 15:38

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同一研究中的不同GEO数据集的表达量级为何不同？（一个为个位数...

1、MINIML的数据大部分是经过标准化后的 2、表达量级不同不代表没有标准化，有可能是取了log和没有取log的区别 3、分析中视情况会取log2

回答于 2018-05-21 15:37

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购买了课程，有发票开吗

我们并未有在线的课程，除非在本站购买，其他地方的请直接联系对应的平台。在本站消费的可以累计开取发票

回答于 2018-05-21 15:35

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TCGA简易下载工具用不了，求大佬解惑

应该是你的系统不兼容，请使用其他版本

回答于 2018-05-21 15:33

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祝老师 edgR包 calcNormFactors，estimateCommonDisp，estimateT...

没有注意过这个问题，应该是去除了一些不满足计算条件的基因，你检查一下看看被减少的基因的表达情况是否有很多0之类的

回答于 2018-05-21 15:31

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批量生存分析结果P值与图片中的Logrank 值不一致？

KM曲线的 p值计算方式和 COX的计算方式不一样的，所以p值肯定是不同，COX是半参数法，p值是非参的

回答于 2018-05-21 15:29

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基因表达值0是什么意思已采纳

一般在RNA-Seq数据中0一般认为是不表达

回答于 2018-05-13 18:33

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请问老师，GEO芯片数据转换工具，数据当中的空值使用什么方法填...

没有做填充，原封不动给你导出来，你自己可以使用KNN法做一下填充

回答于 2018-05-13 18:33

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基因表达值0是什么意思 已采纳

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