祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

偏执又爱折腾的精选伪IT男,求互粉!!! 招募医学数据分析朋友一起探讨肿瘤信息学,微信:13456826965

向TA求助
2272金币数
15620 经验值
441个粉丝
主页被访问 30387 次,10,5.10

1139 个回答

0 赞同

TCGA的甲基化数据是标准化的数据么?可以直接使用么。

是的,可以直接使用 

回答于 2017-11-28 17:15

0 赞同

如何从TCGA数据库中,分析染色体拷贝数的变异(如缺失)情况?

下载CNV数据的数据分析一下不就好咯

回答于 2017-11-28 17:15

0 赞同

怎样快速简洁的从TCGA数据库中提取预后相关信息?

生信人小工具 组合套路可以达到你的要求,比如 TCGA下载小工具 下载临床数据,打开表格后筛选自己想要的数据列,然后再使用批量生存分析工具自动去匹配你的miRNA表达谱和临床随访数据,之后的数据都是整理过的,导入R都可以

回答于 2017-11-28 17:14

0 赞同

WGCNA:模块画出来都是一个颜色

你的数据相关性太高了。。。。嗯嗯

回答于 2017-11-28 17:13

0 赞同

找不到Arraystar Human LncRNA microarray V2.0 平台的注释文件

可以去Agilent官网看看,实在不行就给作者写信

回答于 2017-11-28 17:12

0 赞同

TCGA的miR数据下载下来之后怎么分析?

你这个显然没有合并成功,你使用的是V8版本以下的话 需要在fileID.tmp文件的最后一行 指定想要合并的列,比如你的数据文件中数据列在第三列,就写3

回答于 2017-11-28 17:11

0 赞同

经过DEcenter之后得到的结果文件差异基因文件无显示是怎么回事。

在软件默认的阈值下没有差异,你可以打开那个edgeR.txt文件手动降低阈值筛选一下

回答于 2017-11-28 17:08

0 赞同

怎么剔除WGCNA中不合格的基因

你这需要好好百度一下了。。。。。

回答于 2017-11-28 17:07

1 赞同

GEO芯片数据转换器中转换ID怎么选择

不同的芯片数据因为注释的不一样,ID类别都是不固定的,一般我们选择gene symbol

回答于 2017-11-28 17:07

0 赞同

热图工具导入后,无法绘制热图

应该是你的数据有问题,你试试调整一下那个最大值100,改成20试试

回答于 2017-11-28 17:06