祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

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批量生存分析工具改进建议

感谢建议,后续会考虑更加完善。谢谢

回答于 2017-11-22 11:02

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生存分析问题

1、两种结果一样,都可以,看你具体情况 2、建议做一下归一化

回答于 2017-11-21 20:31

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下载TCGA counts数据后用EdgeR做差异分析,后续如果计算lncRNA与...

1、可以 2、正常可以忽略,如果很多0的话需要去掉 3、变不变换结果差不多 3、lncRNA丰度低,太多0的去掉,其他的正常计算木有太大关系

回答于 2017-11-21 20:07

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求教:多个不同内容的数据集进行整合分析

目前小工具只能单个分析,多芯片整合的需要复杂的操作,建议请专业人士

回答于 2017-11-21 20:04

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GEO数据库如何并联不同的dataset

多平台的芯片合并需要去除批次效应,或者使用相关R包将多个芯片数据处理到同一水平,你谷歌一下

回答于 2017-11-21 20:01

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GSEA简易小工具无法生成my analysis GSEA结果文件夹

你检查一下gmt和cls文件是否是正常的,我猜测是GSEA在你的电脑上运行不正确,你的目录里有空格之类的吗

回答于 2017-11-21 19:59

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R语言的pheatmap遇到的问题

是不是有0值,或者有一列或者一行 值都一样的,这肯定是数据有问题啦

回答于 2017-11-20 20:00

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生存分析曲线显著性差异如何判断?

答问题一:log-rank <0.05 说明高低表达存在显著性预后差异,P Vlaue<0.05 表示连续性变量对预后存在显著性影响 问题二:可以认为有显著差异 问题三:两者存在区别,各有各的道理,酌情选择

回答于 2017-11-20 19:57

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批量生存分析 P值都很高

可能是你随访数据的原因,你看看你的随访数据未死亡的有多少,还有平均随访时间的长短,年龄等等

回答于 2017-11-20 16:54

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批量生存分析工具结果如何解读?

Z值是统计学中的一个重要的概念,也是根据这一指标进行的预后差异性检验,最后一列是p值指的是:Likelihood ratio test; HR指的是:ln(HR),新版的回原来的HR了 95%指的是:置信区间

回答于 2017-11-20 11:50