祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

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1139 个回答

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DEcenter 导入数据后,不能运行,点击后只出现打开位置不能运行,...

是否数据表达矩阵太大,正在读取数据较慢,出现卡顿现象,还是软件是哪个版本?

回答于 2017-11-06 09:54

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TCGA下载工具,同样的文件,用edgeR方法可以运行,选择DESeq2出错

DESeq2 的方法对分组有些要求,你可以把数据发给我:zlf@shengxin.ren  我给你看看

回答于 2017-11-06 09:49

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在使用DeCenter时,软件只运行到检验完成,但是后面的差异好像不...

counts数据筛选差异运行很慢,需要耐心等待,我的电脑四百多个样本跑了两个多小时,至于进程,你要看Rscript进程有没有在,如果在的话就是在运行中

回答于 2017-11-06 09:48

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RNA-Seq数据生存分析时分组,高表达(High)和低表达(Low)是怎...

分组确定方式在右侧如: 以表达量从低到高排序,取前百分比,和后百分比作为高低表达组

回答于 2017-11-06 09:47

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为什么我用批量生存分析工具做生存分析时,导入数据后一直不跳出...

你重新启动一下软件 试试,另外问题尽量有截图,好知道哪里有问题, 比如你的数据是什么 软件设置是什么

回答于 2017-11-06 09:44

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如何用R对多个数据集进行预处理及筛选差异表达基因呢

分别筛选,取交集,或者整合但是需要标准化和去批次效应

回答于 2017-11-06 09:32

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heatmap使用中选择完文件后,提示电脑内存不足,换个电脑也是这...

你的数据太大了,你可以把下面的行距类勾选框去掉,再导入就好了,但是要聚类的话就够呛

回答于 2017-11-02 20:04

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请问怎么对GEO芯片重注释提取lncRNA

给你个参考流程: 文章链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2875241/ 当然也可以那金币来兑换一次定制化的芯片重注释服务:https://www.shengxin.ren/goods/4 已有教程如:https://shengxin.ren/article/439

回答于 2017-11-02 11:50

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从公众号看到的:“ 简易TCGA下载工具-V8”这个软件,小编说在生信...

可以到这里来看看:https://www.shengxin.ren/article/95

回答于 2017-11-02 09:30

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怎样把两个Merge_matrix.txt文件合并为一个

你可以将两个表格第一列进行排序,然后直接合并后面的列就好了

回答于 2017-11-02 09:29