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用r的edgeR包跑出来的结果与DECenter中的结果不符
问题在这里：data=data[rowMeans(data)>1,] 这一行代码卡掉了均值小于1的基因，而软件没有卡这个值
回答于 2017-11-08 10:08
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DEseq，这是出现什么错误了？同样的数据用decenter 中其他方法算...
DECenter的DEseq方法目前存在一些兼容性问题，程序猿正在努力调试中
回答于 2017-11-07 13:08
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DECentre老是闪退，怎么办
1、你贴一下你的数据，应该是你数据的原因，另外你下载的是哪个版本的DECenter 2、热图你可以先把软件下面的row_cluster等复选框勾选去掉，然后导入数据即可，应该是你的数据太大了，一般几千几万个基因的表达谱聚类热图没什么意义的
回答于 2017-11-06 14:12
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TCGA下载工具的ENSG_ID转换和TCGA ID转换器的区别
没什么区别，TCGA ID转换器 将其ENSG_ID这个功能单独拿出来了，以支持用户自己下载的数据
回答于 2017-11-06 10:08
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老师，我想自学生物信息学，想请教您生物信息学和统计遗传学有没...
plink跟R并没有直接的关系，一个是软件，一个也是（编程语言）软件，能不能代替要看plink团队有没有提供相关的R包，至于R软件能否实现所有的生物信息学分析方法，这个肯定是不能的，没有哪种语言可以实现所有的数据分析方法（当然理论上可实现），参考书的话一言难尽了
回答于 2017-11-06 10:06
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TCGA生存分析
这是正常现象喂，每一列代表一种临床随访信息，空的地方表示没有随访信息，详情可以看看：https://www.shengxin.ren/article/96
回答于 2017-11-06 09:58
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