祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

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GEO数据中样本信息没有找到状态列和时间列,可是文献用相同的数...

这是由于左作者上传数据时没有把随访数据上传分享出来,你可以去文章的补充材料找找,如果没有的话只能写信跟作者要了

回答于 2017-10-30 21:51

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如何用BRB对多个GEO数据集进行差异基因筛选

BRB 只能对单个数据集进行筛选差异吧

回答于 2017-10-30 20:30

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请教各位一下LncRNA和mRNA共表达怎么做?,谢谢

可以用WGCNA做,或者直接计算两者的相关性

回答于 2017-10-30 08:33

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GEO芯片的探针名字 hp_hsa-mir-144 中的 hp_ 是什么意思?

hp_ 应该是人为加进去的,直接替换掉即可

回答于 2017-10-30 08:33

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GEO转换器登陆问题

有时候由于服务器不稳定导致部分网络无法连接到服务器,建议你在白天尝试登陆,登陆一次无限使用。 另外不登录破解方法见:https://www.shengxin.ren/question/315

回答于 2017-10-30 08:32

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bwa index hs38DH.fa 这道命令明明已经成功运行了为什么还是报这...

检查一下你建立index时的index名称和你运行比对时的索引名称是否对的上

回答于 2017-10-30 08:25

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GEO芯片数据转换器和批量计算生存分析工具Windows10安装报错,求...

软件无需安装的,你看一下是不是64位和X86的问题,比如32bit系统运行64bit的软件肯定是不行的

回答于 2017-10-30 08:23

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GSE84004描述的是lncRNA的表达,为什么我在用GEO转化器处理完之...

你的这套数据的芯片平台注释只注释到了genebank ID,这些ID本就是lncRNA ID并不是mRNA信息

回答于 2017-10-30 08:20

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我要用你们分析工具分析发文章,怎么引用?

分析工具使用的都是成熟的方法,你直接描述方法就行,无需引用,生信人的工具只是做了个界面并使其更符合大众使用习惯。 当然后续会有方法写作示例分享

回答于 2017-10-28 21:26

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祝老师在么,请问geo数据转换器导出的样本信息

可以修改,修改后保存成txt,不要保存成xls,确保保存正确,可以保存后用记事本打开看看会不会乱码,不会的话软件就能识别

回答于 2017-10-28 21:24