祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

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1139 个回答

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关于GEO提取数据做生存分析

GEO上很多数据并没有随访信息的,需要自己仔细找到这样的数据集,一般你可以搜索 clinical + 你的关键字 然后打开数据集下的样本描述里面会有

回答于 2017-10-23 09:48

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转换ID的列只有这两个,请问是什么原因啊?

你这套芯片数据的芯片平台注释信息只提供了这两项,你可以选择GB_CC

回答于 2017-10-23 09:46

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我在应用DECenter过程中,运行并导出过程中出现以下提示而无法到...

你的数据结果保存目录不存在或者没有权限啥的,你再看一下

回答于 2017-10-23 09:45

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TCGA数据归一工具问题

可以一次处理多个数据的,你的输入数据是啥,软件设置参数截图看一下,排查一下啥情况

回答于 2017-10-23 09:44

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我下载的火山图软件实在不能用,由于有数据要处理,哪位大神帮我...

怎么个不能用呢,有没有多点信息

回答于 2017-10-21 09:54

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下来来了文件,程序却不识别,求助

讲道理我也不知道你下载的文件名为啥是那样子的,我的下载的文件名字是下面截图那样的,结尾是tgz,你的是gz,两者还是有一丢丢差别的,比如gz前面多了个t,这就意味着他是一个多个文件的的打包压缩的,而gz格式的一般是只有一个文件的压缩方式,软件只支持tgz,还有一点就是GEO上面下载经常不稳定导致一些数据总是下载不全...

回答于 2017-10-20 17:34

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使用简易TCGA下载工具的若干问题!谢谢

1、正常,空的地方是本身没有记录,每一列表示一种临床随访信息,看表头 2、信息一样,并且更新 3、目前没有,建议使用excel处理一下,比如vlookup函数

回答于 2017-10-19 14:05

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DEC运行报错!

1、生成的那三个文件就是结果 2、那个错误信息是个警告,可以不用管 3、因为很多人总是忘记 “是否log” ,所有新版本中去掉了这个选项,程序自动识别是否log

回答于 2017-10-19 10:16

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GSEA结果解读遇到问题,求解答,谢谢!

结果解读看这里 https://www.shengxin.ren/question/317 不是上下调,是你分组的H和L样本中表达水平的排秩,ES小于0 在L中富集,大于0在H中富集

回答于 2017-10-19 10:12

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可是还是会一直提示没有匹配样本,数据已经检查过了,是有匹配的...

给个详细的各个表格的截图以及软件界面的参数啊

回答于 2017-10-19 10:10