祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

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DEC中统计方法的选择?

如果数据集比较好的话 差异的基因相差不会太大的,使用多个统计方法取交集也行

回答于 2017-10-18 10:47

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请教一下,生存分析是为什么一直出现以下的情况,我的时间是月,...

如果你确定是月的话点击“是”就行,他只是提示你可能时间单位(你的最大月数比较小的缘故)有问题。

回答于 2017-10-18 10:41

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DEC分析miRNA数据,方法选择limma包吗

如果是芯片数据的话可以选择limma,如果是FPKM的话也可以

回答于 2017-10-18 10:39

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你好,那个生存分析还是一样,分析不出来,样本明明是匹配的?有...

GEO的数据选择GEO的数据类型,如果TCGA的数据的话需要做一下标准化

回答于 2017-10-18 10:38

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关于简易tcga下载工具的下载选项

isoform和非isoform的区别在于isoform提供了更多的信息,比如isoform里有3p,5p等,但是新手匹配起来挺麻烦,下载的数据当中包含FPKM和counts两列的

回答于 2017-10-18 10:37

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使用网站上下载的生信工具,输入账号密码却上不去

看这里https://www.shengxin.ren/question/315

回答于 2017-10-17 22:43

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下载的聚类和火山图软件已经注册了邮箱,登录后,软件还是没反应

看这里https://www.shengxin.ren/question/315

回答于 2017-10-17 22:42

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请教一下,为什么用工具分析TCGA生存的数据,为什么一直出现下面...

你这不是GEO的数据吗,检查一下表达普的第一行和样本信息的第一列有没有对的上

回答于 2017-10-17 22:39

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TCGA简易下载工具能不能下载临床数据?

你需要在左侧选择你要下载的癌症,双击即可,会展示该癌症所有可以下载的数据包括临床随访资料等信息,当然前提是你的网络能够连上TCGA

回答于 2017-10-17 13:46

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使用GEO小工具的过程中,miniml无法下载

正常点击miniml打开后是类似这样的: 1、你确定一下你是否能够打开GEO的ftp,链接如:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE100nnn/GSE100007/miniml/,如果可以打开那么应该是你那个数据集没有提供该数据类型的数据,这种情况一般为非芯片平台的数据,建议使用其他方法 2、如果不能打开说明你的网络无法访问到该数据...

回答于 2017-10-17 09:35