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批量生存分析软件运行后数据缺失问题
TCGA数据做cox最好做一下标准化（用这个：http://gap.shengxin.ren/tool/6/），因为数值区间太大，很多基因无法计算出cox，就被过滤了
回答于 2017-10-16 20:58
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你好，用贵公众号的 简易TCGA下载工具 下载临床数据，合并后格式...
每一列表示不同的随访信息，具体看表头，空着的地方表示该项随访数据丢失，当然具体的可以参考一下这个：https://www.shengxin.ren/article/96
回答于 2017-10-16 20:56
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你好，谢谢你的回答，我还没明白，我从GEO数据库下载了一个数据...
你的这个数据是GPL570的基因芯片平台，无法直接从里面提取lncRNA，需要做lncRNA重注释才能得到
回答于 2017-10-16 08:01
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用GEO芯片数据转换器，为什么选择转换id的列没有Gene Symbol这个...
是的。跟芯片类型有关，你的这个芯片平台没有注释到Gene Symbol，所以就没有这个选项
回答于 2017-10-16 07:59
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DEC和简易GSEA运行出错
1、DEC的结果是警告你的数据存在问题，可能有些基因在各个样本中的表达都为0 2、GSEA的结果可能也是你数据存在一些问题，你看看数据中是否有上述的这种情况
回答于 2017-10-16 07:57