祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

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1139 个回答

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按照步骤,DEcenter显示错误,请老师帮忙看看,指导一下。

你第四列的5 ng/ml human recombinant BMP9 for 24hrs 带有和路径类似的字符/ 你换成简单的分组信息就好了

回答于 2017-10-16 07:54

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你好,请问什么时候会出GEO芯片数据转换器 x86版?

应该是快了,程序猿正常努力

回答于 2017-10-15 14:53

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运行DECenter又报错了,这是什么意思啊,求指导!!!

请使用最新版的Dec

回答于 2017-10-15 14:52

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DEC小工具使用报错,求指导!

这个问题使用最新版的DEC可以解决,主要是你的结果保存目录和你的数据输入目录一样导致的,这会使得你输入的数据矩阵发生改变

回答于 2017-10-15 14:51

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您好,GEO数据库下载下来的数据集怎么区分出mRNA跟lncRNA?有没...

GEO芯片数据分不同的平台,mRNA和lncRNA平台不同,使用GEO数据转换工具可以分别提取出来,然而你可能问的是lncRNA重注释相关,这个就需要其他方法了

回答于 2017-10-15 14:49

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使用DECenter时显示数据出错?求指导!

1、不要有中文路径和中文文件名 2、结果保存目录尽量为单独的一个文件夹 3、请使用最新版

回答于 2017-10-15 14:47

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批量生存分析工具咨询

问题1:过滤规则为匹配上的样本中都有表达水平,如果存在数据缺失则会自动过滤掉 问题2:由于不同的计算机语言的数据精度处理方式不同存在你说的那个现象,这个并对数据结果影响极小,应该是数据处理方式的问题,软件中的结果可以使用软件输出的数据使用R进行复现 问题3:同一,实现批量可以使用for循环,我猜测你的数据...

回答于 2017-10-15 14:45

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老师们好,用火山图绘制软件,数据导入后,点击绘图,可是软件没...

你看一下你的数据格式,尤其是logFC和p.value那两列是不是都是数字

回答于 2017-10-14 15:34

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运行DECenter出错,求指导!

样本类型列为:第1列?? 这个确定是正确的吗,你的分组列选择坚持一下,另外foldchang默认是取了log2的,也就是说2倍的画 填1就行了

回答于 2017-10-14 15:32

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GSEA的结果解读?

简单理解:你这个图的这个通路Gene Set倾向出现在L-RRM2那一类(如果你是按照RRM2表达水平分组的话,那就是L组)中,因为ES最高点在左侧,越左表示越富集。反之在右侧类似。 这里提到分组,生信人工具箱里有个自动分组的GSEA简易使用工具:http://gap.shengxin.ren/tool/4/ ES计算方法如下: 参考链接: http://www...

回答于 2017-10-13 21:38