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clusterProfiler使用疑问

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  • zyl 2020-06-18 15:26

安装TCGAbiolinks报错： 'namespace:limma'没有出口‘toptable’这个对象

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GSEA简易小工具使用报错

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如何评价基因组的组装效果？

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GEO数据转换器转换的文件用EXCEL打开就提示这样，怎么解决啊？

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RNA-seq分析中怎么把FPKM的数据批量转换成TPM

1 回答

生信盒子的GSEA功能无法使用？

2 回答
  • zjc 2017-09-28 20:58

请问如何从TCGA下载小工具里下载microarray的数据，不是RNA-seq？谢谢

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DEcenter无法启动

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点击启动软件时只出现“启动完成”，然后没什么反应，这是什么问题？

1 回答

GEO通过R语音分析产生差异序列分析DEG.TXT，接下来如何产生用于heatmap分析的数据,的文件，用于R语言heatmap产生热图？

2 回答

SangerBox无法启动

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做生存分析时进行逐步回归

1 回答
  • 慧源 生信一期 2018-01-29 13:39

TCGA简易下载工具的问题

1 回答

祝老师您好，想请教下用筛选到的所有差异基因做WGCNA计算TOM，总是出现NAN，但若先中数排序挑前N个做就不会有这种情况，是因为差异基因里有太多极小的FPKM值吗？那以什么原则来剔除数据呢？

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祝老师：按照您的方法重新分列了，可以正常选择，但是就是不出来图，下一步该怎么办

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geo数据库下载的bed文件、cel文件、idat文件，soft文件分别代表什么，是不是做的内容不一样？如果可以，怎么整合

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ID转换器

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求大神指导怎么操作，稍微具体点

0 回答

10 RNA-seq 差异表达 无重复样本

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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