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  • titi 2018-05-07 15:33

如何使用SRA数据

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请问：您有统计基因组序列信息的脚本吗？比如得到它的n50， gc含量，覆盖度等，谢谢

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有关TCGA临床数据下载的问题

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  • tnt 2017-11-07 10:03

用DECentre老是闪退，导入矩阵数据后就出现程序停止运行

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下载工具样本命名方式

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15 TCGA下载的乳腺癌临床数据中指标的具体解读

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GATK的HaplotypeCaller能不能做somatic（cancer）variant discovery呀？虽然官方推荐使用MuTect2，但是我不太懂其中道理

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差异分析log2fc=0.01，可以吗，试了很多数据，log2fc=1时就没有差异基因，谢谢

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  • Dust 2017-04-14 21:39

5 请问怎样获得新版TCGA中同一肿瘤的不同亚型数据？谢谢

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用癌组织和癌旁组织找出来的差异基因能说明什么问题呢？能用于区分癌症病人和正常人吗？谢谢

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  • zyl 2020-06-18 15:26

安装TCGAbiolinks报错： 'namespace:limma'没有出口‘toptable’这个对象

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3 乳腺癌RNA-seq差异基因分析需要先排除基线（如年龄等）的影响吗？如果需要怎样找到癌旁组织的临床基本信息？谢谢

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15 DECenter运行出错 请检查日志和你的数据

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  • hsm 2018-01-04 22:05

我导入到GEO小工具里时，出现数据解析错误，要我检查数据格式，可是我是下载的MINIML格式啊？

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问一个简单的问题：基因间隔区是什么意思？可以被转录么？

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一键WGCNA运行后显示“导出成功”，但是Report.html中一直提示“WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试！”

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GSE31046中GPL13996注释只有spot ID，而用这个ID在NCBI中找不到对应基因？

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3 GSEA软件分析相关的问题

2 回答

SangerBox无法启动

3 回答

TCGA数据下载后如何分析？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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