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选择原文一样的条件，做不出DEG

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5 请问Estimate生信技术适合血液肿瘤吗？

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利用TCGA简易下载工具下载完癌样本和正常样本的RNA-seq并一个表达谱矩阵后，怎么区分矩阵中哪个是正常样本？哪个是癌样本？

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GSE31046中GPL13996注释只有spot ID，而用这个ID在NCBI中找不到对应基因？

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RNAseq数据经过hisat2、stringtie处理后的如何得到一张二维表，方便之后作分析、画图

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GATK的HaplotypeCaller能不能做somatic（cancer）variant discovery呀？虽然官方推荐使用MuTect2，但是我不太懂其中道理

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请问GEO数据做DEcenter差异分析，edgR出现“ERROR : negative counts not supported ”，什么原因？

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一般那个wgcna的WANGA网络分析报告要等多久呢

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一键WGCNA运行后显示“导出成功”，但是Report.html中一直提示“WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试！”

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3 DECenter-V6使用障碍

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差异分析log2fc=0.01，可以吗，试了很多数据，log2fc=1时就没有差异基因，谢谢

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TCGA数据下载后如何分析？

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用癌组织和癌旁组织找出来的差异基因能说明什么问题呢？能用于区分癌症病人和正常人吗？谢谢

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如何评价基因组的组装效果？

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3 乳腺癌RNA-seq差异基因分析需要先排除基线（如年龄等）的影响吗？如果需要怎样找到癌旁组织的临床基本信息？谢谢

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  • hsm 2018-01-04 22:05

我导入到GEO小工具里时，出现数据解析错误，要我检查数据格式，可是我是下载的MINIML格式啊？

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问一个简单的问题：基因间隔区是什么意思？可以被转录么？

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15 DECenter运行出错 请检查日志和你的数据

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3 GSEA软件分析相关的问题

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  • zyl 2020-06-18 15:26

安装TCGAbiolinks报错： 'namespace:limma'没有出口‘toptable’这个对象

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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