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  • lee 2017-11-19 21:03

批量生存分析工具结果如何解读？

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10 我在用R语言ConsensusClusterPlus包做共识聚类以后，使用sigclust做聚类效果的评估，为什么不管换什么数据，1类与2类之间的p值总是1呢？

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请问大神有没有limma包对txt文件筛选差异基因的代码，不胜感激！

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R语言和GEO2R得到的差异基因差别很大，哪一个结果更准确一些

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TCGA下载的样本后面跟上rep是什么意思呢？可以删除这组数据吗？是指重复吗？

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  • xkw 2017-08-25 23:29

5 三部曲里芯片探针注释基因ID或者symbol，并对每个基因挑选最大表达量探针

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请问：您有统计基因组序列信息的脚本吗？比如得到它的n50， gc含量，覆盖度等，谢谢

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有关TCGA临床数据下载的问题

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下载工具样本命名方式

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  • tnt 2017-11-07 10:03

用DECentre老是闪退，导入矩阵数据后就出现程序停止运行

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  • titi 2018-05-07 15:33

如何使用SRA数据

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3 启动软件，总是提示找不到JAVA虚拟机！

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  • LXG 2019-04-08 21:04

老师，您好。我在用GEO转换器的时候老是错误，没有结果。

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3 TCGA seq数据6万多个基因位点ID转完后只剩1万多个，丢失了很多信息，除去没有对应的geneID还差好多，怎样才能转换完全？谢谢

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15 TCGA下载的乳腺癌临床数据中指标的具体解读

1 回答
  • Dust 2017-04-14 21:39

5 请问怎样获得新版TCGA中同一肿瘤的不同亚型数据？谢谢

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GEO数据提取转化工具（生信人工具盒8）可以提取胃癌GSE15459、GSE29272的矩阵数据，但无法提取病理资料（如性别、年龄、转移、分期、生存等），这2个系列文章报告是可能提数据的。有高手帮忙试下吗，看问题出在哪

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您提的那个RRA的问题解决了吗

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ROC曲线

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10 安装GenvisR包总是报错

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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