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sangerbox安装后启动DEcenter工具失败

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  • UWI 2018-07-07 23:14

请问老师，从TCGA下载临床数据，想和前面的miRNA表达谱一起进行生存分析，我应该下载哪个格式的，三种有差别吗，谢谢老师啦。

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Ganbank的问题

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数据归一化工具中，好像是按样本一列一列归一化的，那之后我们需要对每一行进行标准化吗

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请问便捷ID转换这个软件是根据哪个数据库对lncrna，mrna和mirna进行区分的呢，写文章时要怎么说呢？

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之前已经安装R软件了 版本是3.25，但运行DECenter简便的差异分析工具时还是提示该插件需要R才能运行。

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20 y <- DGEList(counts=data,group=group) Error in .isAllZero(counts) : counts must be positive finite values > data[1:10,1:10]

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关于exon expression的问题

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做多因素回归分析的时候 cutoff 值怎么确定。为什么做出来的图没有ROC曲线。谢谢各位大神不吝赐教。

1 回答
  • L 2018-04-18 20:40

10 TCGA标准化化后的反相蛋白质阵列基因芯片( RPPA)数据（level3和level4）推荐用什么算法进行差异分析？

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WGCNA无法去除离群样本

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批量生存工具，成功匹配到样本，计算完成0个

0 回答

根据P值自己在Diff.txt.文件中筛选出来，还是TopExp.txt文件里就是top差异基因？

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批量生存分析时遇到删失的数据怎么办

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TCGA简易下载工具合并文件问题

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TCGA简易下载工具V10

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5 TCGA建议下载工具找不到TCGA-CESC、COAD等多个数据集，请问是什么原因呀？

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肺腺癌拷贝数，甲基化，mirna数据如何下载

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3 如何分析基因随药物处理的浓度梯度变化的趋势？

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  • JUN 2017-11-27 20:31

怎么剔除WGCNA中不合格的基因

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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