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差异基因的foldchange及p值怎么计算

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下载的TCGA COUNTS数据，发现2列数据对应同一个肿瘤患者如下，怎么处理？

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之前已经安装R软件了 版本是3.25，但运行DECenter简便的差异分析工具时还是提示该插件需要R才能运行。

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3 为什么我用用生信人box里的插件一步一步分析的数据会没有差异基因，而用GEO2R则能得到很多差异基因？

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5 请问怎样预测基因结构，比如内含子和外显子

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自己通过matrix文件筛选的差异基因分析结果和软件自动生成的代表性差异基因结果不一致

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你好，那个生存分析还是一样，分析不出来，样本明明是匹配的？有什么原因呢？求指教

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  • 武琦 生信一期 2018-09-27 09:44

Treeview绘制热图时，如何制作颜色标尺？

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求问不同数据集相同的差异基因怎么画热图来看它在不同数据集里的表达情况，谢谢

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10 GEO便捷转换器导出表达矩阵后不提示导出成功，mergeExpro文件大小为0

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新版TCGA下载工具怎么提取临床信息呢

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  • 醒 生信一期 2018-06-17 16:10

平台注释文件里没有gene symble 怎么做GSEA分析？？导入GSEA里显示运行失败！！

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fileID.tmp文件编辑后，TCGA下载工具合并后为什么又恢复成原来的数据？

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WGCNA临床信息赋值

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Geo转化器转出来的样本信息是文本格式 但是同学的是exl的是为什么

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请教一下，有没有人会做GATExplore的LncRNA的mapping?急

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  • ZR 2019-03-20 19:34

GPL570的LNCRNA重注释最后输出存在BUG，最后有约800个探针乱码

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10 请问R语言如何实现这种图？

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3 DEcenter出错，请大侠们指教，表达矩阵和分组都应该没有错误。。。。是经过RMA处理转换Genesymbol和KNM处理后的表达矩阵，选择后只能显示前94个的表达矩阵，后面的1万多个基因的表达矩阵在DEcenter上面不显示。

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生信工具盒进行DECenter差异分析点击运行并保存跳出文件保存窗口，保存窗口弄好保存路径后出现错误提醒：先用工具盒安装R软件，安装了仍出现这样的错误提醒？求各位前辈指点，谢谢

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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