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Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析,GSEA)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势,从而判断其对表型的贡献。其输入数据包含两部分,一是已知...
GSEA定义: Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势,从而判断其对表型的贡献。其输入数据包含两部分,一...
ssGSEA顾名思义是一种特殊的GSEA,它主要针对单样本无法做GSEA而提出的一种实现方法,原理上与GSEA是类似的,不同的是GSEA需要准备表达谱文件即gct,根据表达谱文件计算每个基因的rank值,再进...
TCGA、GEO、GSEA富集分析套路解析!
本节分析是文章中所没有提到的分析,作为我们文章外的拓展知识扩充进来,那么小编最近也是看到有些小伙伴也在问关于GESA的相关问题,那么这里就是给大家做出了演示以及怎么分析、结果怎么解读哦...
GSEA是什么,这个请自行百度,在使用之前要知道GSEA是啥 然后上工具截图: 一般情况下咱们要做GSEA需要准备三个文件 1、gct格式的表达谱 2、分组文件 3、富集的背景文件,也就是gmt格式的...
官网 http://software.broadinstitute.org/gsea/index.jsp
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