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1、找到你感兴趣的GO或pathway,比如你要找肿瘤相关的,那就找肿瘤相关的通路 2、在你感兴趣的pathway中找出你的输入基因 3、这些基因的上调、下调你自己本来就知道
回答于 2017-09-15 11:33
你的的这个矩阵有六万行几百列这么大的矩阵做聚类的话肯定内存不够的,并且你这样聚类出来的热图也没有什么意义,你可以选择其中一部分基因的表达谱来做聚类热图,这才是正确的姿势。
回答于 2017-09-13 15:12
GLIBC库版本可能需要升级,找管理员升级一下GLIBC
回答于 2017-09-12 11:47
从你的图一中来看这两个模块与NFT相关性都不算高,显著性也就一般,建议你两个模块都选
回答于 2017-09-12 09:29
最近墙有点高,TCGA官网不稳定
回答于 2017-09-11 14:47
直接用差异基因的FPKM做WGCNA是可以的
回答于 2017-09-11 09:42
fpkm可以用limma或者直接T检验
回答于 2017-09-10 17:59
1、详细检查参数集那个gene是否是 ENTRZ ID 2、可能你的那些ID并未在kegg中收录 3、网络问题
回答于 2017-09-10 14:28
用Excel筛选不就可以么
回答于 2017-09-10 14:26
看这个答案:https://www.shengxin.ren/question/229
回答于 2017-09-10 14:25