祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

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1139 个回答

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利用TCGA简易下载工具下载完癌样本和正常样本的RNA-seq并一个表...

看列名:癌症样本末尾是-10以下的

回答于 2017-09-10 14:25

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GEO芯片数据转换器-V1登录,总是提示用户名或密码错误

由于系统更新延迟的原因,目前两个平台的账号还没有完全同步互通,你可以使用免登陆方法,在软件目录下  新建一个空文件licence.user即可免登陆使用

回答于 2017-09-10 14:22

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TCGA counts标准化

z-score在R中的函数是 :scale

回答于 2017-09-10 14:18

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RSEM 和 RPKM的差别,及原理

看这篇文章:https://www.shengxin.ren/article/150

回答于 2017-09-10 14:17

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TCGA简易下载工具得到的合并文件中数据行有错位,请问怎么处理?

1、每次合并 microRNA名字顺序是随机的,所以两份的错位是正常现象 2、两份数据要再次合并的话可以使用Excel的vlookup函数

回答于 2017-09-07 19:07

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TCGA简易下载工具下载问题

在软件的右上角复选框中把勾选的全都去掉,再下载试试

回答于 2017-09-07 13:00

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有没有mac版的TCGA下载工具呢?亲们

目前还没有,正在来的路上

回答于 2017-09-01 17:33

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TCGA下载工具下载下来的RNAseq数据,经过合并后,需要进行其他处...

一般情况下可以直接用,也可以做一下z-score或者转换TPM

回答于 2017-08-31 09:32

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临床数据和表达数据合并

可以自己编程进行匹配,也可以使用Excel的vlookup命令进行,当然可以再等待生信人的工具:https://www.shengxin.ren/article/145

回答于 2017-08-31 09:29

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求TCGA数据库提取临床数据的perl脚本

社区里有多种方法可以提取,一定要纠结于perl么 比如 TCGA简易工具的ClinicalFull功能

回答于 2017-08-28 09:37