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merge_matrix 里面有60490行，但是转换之后就24993行，是有些ENG...
一对多的关系，V6计算的是均值，ENSG对应的基因是从NCBI下载的
回答于 2017-08-07 15:23
大神，有个问题是Merge_matrix.txt.cv和Merge_matrix.txt.cv.lnc...
人的基因个数本来就不到三万，多出来的2万多个是一些未知的转录本（非编码、假基因、siRNA等等），这些数据只有人的！
回答于 2017-08-04 09:24
请问使用小工具下载了乳腺癌的RNA-seq数据，合并、ENSG-ID转换之...
ENSG-ID转换之后会有Merge_matrix.txt.cv.lnc.txt、Merge_matrix.txt.cv.txt两个文件，分别为lncRNA和常见geneSymbol的，至于 ENSG00000167578.15是ensembl数据库的ID,表示转录本
回答于 2017-08-03 21:38
【Python】关于排序的问题
丢给你一段代码 class Node(object): def __init__(self, name): self.parents =[] self.nexts = [] self.name=name def build(): _list=[(1,2),(3,5),(3,9),(8,6),(3,8),(5,10),(2,10),(2,3),(8,10),(8,3)] _map={} for n in _list: if n[0] in _map: n1...
回答于 2017-08-03 21:27
关于DESeq和edge R做差异表达的一些疑问
一般情况下筛选低丰度有两个常见的指标： 1、去除最低的10-20% 2、FPKM>1 对于测序丰度这个记得好像DESeq会自己标准化，不需要考虑测序深度问题
回答于 2017-08-03 20:25
TCGA下载小工具查不到GBM . Array-based Gene Expression (EXP-...
到这里看看有木有你要的：https://genome-cancer.ucsc.edu/proj/site/hgHeatmap/
回答于 2017-08-01 21:15