1139 个回答
5 赞同
请问下载的TCGA 甲基化数据如何表示某个基因的甲基化水平呀，是...
有两种方式，看具体情况具体分析 一、该基因上所有cpg位点的平均值 二、该基因启动子区域cpg位点的平均值
回答于 2017-05-26 20:43
0 赞同
1 赞同
Affy平台原始数据预处理，MAS5.0
先安装依赖包 source("http://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite("affy") 例子假设下载了6个CEL的数据放在了D:\work\piplineTest\CELtest： library(affy)setwd('D:/work/piplineTest/CELtest')#设置目录rawdata <- ReadAffy()#读取当前目录下全部CEL#rawdata1 <- ReadAffy('GSM1049165_MDA-HNS-112.CEL....
回答于 2017-05-24 19:08
0 赞同
请问有人会用starbase进行lncRNA和miRNA的比对吗？做ceRNA网络中...
截图中用词不严谨，不应该是比对，直接拿miRNA到http://starbase.sysu.edu.cn/mirLncRNA.php 网站中输入miRNA即可得到miRNA与lncRNA的互作关系如图： 从中筛选出你自己的miRNA与lncRNA即可得到你想要的。
回答于 2017-05-22 08:14
0 赞同
TCGA下载的GBM数据中哪3个文件是somatic mutation，CNV和gene ex...
写个脚本转换一下就可以，突变的为1，未突变的标记0，最后形成一个0-1矩阵
回答于 2017-05-22 08:10
2 赞同
0 赞同
0 赞同
蛋白数据和转录组数据的整合分析
978个基因的互作数据是从string数据库拿到的，整合表达谱无非是在网络中节点标记上表达水平高低，是否差异等～ 至于关联分析 生信人有一套完整的蛋白组与转录组管理分析方案，不过是收费的，具体请找 生信人 市场负责人
回答于 2017-05-09 09:45
0 赞同
0 赞同