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在TCGA数据库中GBM miRNA数据中只有5个，但是我在文献上看到他们...
最新版的TCGA只提供了5例，如果要找到其他的样本你可以去过去的研究中有没有提供数据下载的，比如有些人就将之前的TCGA数据做了备份还提供下载如：GSE62944
回答于 2017-06-26 13:35
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TCGA简易下载工具RNASeq的htseq-count数据是你们自己根据rsem值...
最新版TCGA 已经提供了read count，不需要自己去转，你看V2 pipeline是老版的。
回答于 2017-06-26 13:27
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TCGA简易下载工具V8运行时提示“'ascii' codec can't decode byte...
V6和V8的区别可以看这里：https://www.shengxin.ren/article/95 这个可能是小工具需要的有些系统文件丢失了，V8版本做了较多的内存优化，所以对系统有些要求，V6版本是32位的，效率上可能慢点，和V8大部分功能是一致的，你可以使用V6，如果要使用V6转lncRNA的表达谱，可以将V8文件夹下面的ENSG_ID_LNC.txt文件替换V6的ENSG...
回答于 2017-06-21 09:34
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利用简易TCGA下载临床资料，到处数据后感觉是乱码了吗？（见下图...
这是表格矩阵，不是乱码，只是信息比较多而已，可以把自己用不上的信息删掉，每一列都是一项随访信息 你可能需要这个：TCGA临床病理随访资料解读
回答于 2017-06-15 10:49
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关于TCGA中GBM数据的使用
给你一个例子： 已有研究表明MGMT基因启动子区域cpg岛甲基化对这些患者的化疗药物敏感性具有重要的意义。我们选择了77个样本，分析这些样本中MGMT基因的启动子区域cpg岛的甲基化水平，根据每个样本的甲基化水平进行排秩，选择cpg岛内的cpg位点甲基化水平中位数大于0.35的定义为高甲基化(HighMethy)，小于0.35的定位为低甲...
回答于 2017-06-14 15:09
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怎么从TCGA下载的数据中提取lncRNA的信息？求详细步骤，恳请大侠...
你需要这个：https://www.shengxin.ren/article/1
回答于 2017-06-13 17:31
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