祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

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1139 个回答

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如何获取生育情况,体重指数等信息

使用小工具的ClunicalFull按钮应该是能提取出所有患者预后信息的,具体详解请参考: https://www.shengxin.ren/article/96

回答于 2017-08-01 16:15

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TCGA小工具安装v8的时候提示这个错误,有什么解决办法吗?

这个是系统问题,目前没有什么好的解决办法,建议换其他版本试试

回答于 2017-07-31 12:57

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TCGA工具下载临床数据,点击合并文件按钮的时候出现“合并文件出...

有可能你下载的数据存在丢失 看这里:https://www.shengxin.ren/question/116

回答于 2017-07-28 20:53

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生信小白一枚,现在获得一株菌的全基因组,想用t检验分析这株菌...

这个问题太大,建议你分成几块来提问,尽可能提供: 1、分析背景 2、已有哪些数据 3、想做什么 4、已做了什么 5、遇到的困难及思考

回答于 2017-07-28 09:36

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WGCNA

推荐使用FPKM 常见情况是: lncRNA的丰度低于mRNA miRNA的丰度高于mRNA 但是WGCNA主要使用的是相关性,所以理论上可行。

回答于 2017-07-28 09:30

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为什么我在用gdc-client下载tcga数据的时候,一点回车,它就显示...

TCGA下载简易小工具可以帮你

回答于 2017-07-28 09:28

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fisher检验富集分析

fisher检验类似于列联表,(30,20,1870,80):这里的30,20表示的是差异和非差异,文中20,50也表示差异和非差异,50并不是表示所有mapping到A通路的基因,所以不需要再减20

回答于 2017-07-24 09:22

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请问Blast安装后如何下载并安装数据库?

你的问题描述的很不清晰 首先:blast安装的是blast还是blast+ 其次:在linux下安装还是windows 下载安装数据库一般的途径是先下载你的数据库的序列,然后使用相对应你blast版本的makedb命令进行建立(安装)此数据库。

回答于 2017-07-23 14:07

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lncRNA的识别

mRNA部分是转换的常见的基因(包括部分非编码和假基因的,大概有三千左右,实际编码蛋白的基因不到两万的样子),因为有些lncRNA其实是没有明确界定的(有可能会表达),你的这个属正常现象,如果实在介意的话可以自己再进一步去除。

回答于 2017-07-23 14:04

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WGCNA使用疑问

首先: 第一张图中的表格代表的是共表达模块与样本关系的矩阵,举个例子MEred那列表示red模块,你的样本数为n,red模块中包含了100个基因,那么MEred那列就是一个长度为n的向量了,这个向量代表了该模块中100个基因的表达水平(这100个基因在n个样本中的表达水平即n*100的矩阵),可以简单的理解为计算每个样本在这100个基...

回答于 2017-07-21 09:54