祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期
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1139 个回答

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TCGA下载工具中,请问ENSG_ID转换成Gene_symbol，是对那个文件进...

在安装目录下有一个ENSG_ID.txt文件，那个就是ENSG与gene symbol对应的文件

回答于 2017-05-07 14:54

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如何利用TCGA数据进行生存分析

先下载下来，然后再 进行样本表达的miRNA-seq 与样本临床病理资料进行对应 之后再进行生存分析

回答于 2017-05-05 23:17

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用下载工具下载TCGA数据名字问题

你這个文件名 是样本合并之后的，你先看看文件里面的内容，不出意外的话样本编号在文件中 的表头或者某一列

回答于 2017-05-05 23:15

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TCGA下的CNV文件分析问题

可以看nocnv

回答于 2017-05-04 08:40

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请问有没有大神用过mVISTA?输入文件里边的注释文件怎么生成吖？

可以自己用脚本生成，箭头表示正负链，后面数字是基因组位置，第三列是基因元件类型

回答于 2017-05-02 22:42

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谁告诉我这个基因组序列可视化比对的图是怎么做的？拜托拜托

可以使用IGV软件

回答于 2017-05-02 22:40

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GEO中数据的深层次分析

既然你已提到比较不同分期，不同生存状态，性别等来寻找潜在标志物，其实有很多这种研究的文章，你可以查一下，大体思路从多维数据中提取特征，再进一步挖掘关键因子，主要是GEO数据样本量很多都比较小，所以能做这样的事的文章较少。而做差异比较简单。

回答于 2017-05-02 10:46

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请问有生信方面的培训吗？

短期培训基本上不会有太大效果，最好跟着项目走一遍。

回答于 2017-04-30 17:15

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简易TCGA中下载列表中都表示什么？

這个请自行百度吧，RNA-Seq、SNV、miRNA、Clinical 关键字

回答于 2017-04-30 17:14

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TCGA数据下载之后用什么工具分析？

数据下载之后可以根据你的需求选择R或者其他软件进行后续分析

回答于 2017-04-30 17:12