祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

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关于如何能下载到足够的临床数据

临床数据挺难找的,你这种情况也属正常

回答于 2018-02-20 18:47

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TCGA临床数据合并后,药物名称一列中有些栏出现了多种药物,求高...

用##连接的就是用了多种药物的,应该还有一列是表示用药时间的互相对应的

回答于 2018-02-19 10:39

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请教各位大神,为什么用R语言做差异基因,最后查看的时候可以看...

你write.table里面没有指定保存在哪个目录下,默认就保存到你的工作目录,当然估计你也没有设工作目录,这是一个不太好的习惯。你要找的话可以运行一下getwd(),会得到一个路径,你在那个路径下找就能找到

回答于 2018-02-15 13:16

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求助!关于miRNA-seq接头序列

接头跟建库的方法有关,直接搜建库试剂盒和方法对应的去接头策略。 PS:一般上传的数据都是去过接头的

回答于 2018-02-15 13:12

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Copy number variations怎样去分析?谢谢

这个问题太大了,简单来说 CNV的变化与对于区域的基因表达有关,多拷贝和低拷贝直接影响拷贝内的基因集体的表达变化。照这个推理去看文献

回答于 2018-02-15 13:10

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ID转换时部分ENSG不转换为gene symbol

老版本的 ID转换器的数据来源是基于biomart的,这个新版本的ID转换器的数据来源是根据TCGA使用的gtf文件中提取而来,里面记录的信息更为全面一些,这些ENSG编号转换完还是ENSG编号的主要原因是在这个gtf版本中被认为是新发现的,也就是说這些基因的SYMBOL还没有定下来,这也就导致了不同数据库中SYMBOL的名称不同,故此为避...

回答于 2018-02-15 13:07

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为什么制作热图的时候一直在显示绘图?

应该是你的矩阵太大了,电脑内存不足

回答于 2018-02-15 12:55

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DECenter中DESeq2分析基因表达差异时报错

你这个问题应该是你的网络无法访问到https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.4/PACKAGES导致某些关键的R包没有安装成功,建议更换网络

回答于 2018-02-15 12:54

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TCGA临床信息——tobacco_smoking_history 中1,2,3,4,5 分别表示什...

是的,表示吸烟的不同的程度

回答于 2018-02-15 12:50

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如何下载有circle rna 的GEO芯片

目前cirRNA数据还比较少,你可以在GEO上直接检索 cirRNA关键字查找

回答于 2018-02-15 12:49