你write.table里面没有指定保存在哪个目录下,默认就保存到你的工作目录,当然估计你也没有设工作目录,这是一个不太好的习惯。你要找的话可以运行一下getwd(),会得到一个路径,你在那个路径下找就能找到
回答于 2018-02-15 13:16
这个问题太大了,简单来说 CNV的变化与对于区域的基因表达有关,多拷贝和低拷贝直接影响拷贝内的基因集体的表达变化。照这个推理去看文献
回答于 2018-02-15 13:10
老版本的 ID转换器的数据来源是基于biomart的,这个新版本的ID转换器的数据来源是根据TCGA使用的gtf文件中提取而来,里面记录的信息更为全面一些,这些ENSG编号转换完还是ENSG编号的主要原因是在这个gtf版本中被认为是新发现的,也就是说這些基因的SYMBOL还没有定下来,这也就导致了不同数据库中SYMBOL的名称不同,故此为避...
回答于 2018-02-15 13:07
你这个问题应该是你的网络无法访问到https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.4/PACKAGES导致某些关键的R包没有安装成功,建议更换网络
回答于 2018-02-15 12:54