我们跟据XX基因的表达对样本进行分组,选择表达量最高的X%作为高表达组,最低的X%作为低表达组,进一步做K-M曲线,我们发现他们具有显著的预后差异(logrank p=xxx)。
回答于 2018-02-02 14:16
软件右侧有选择差异分析的方法,你可以自己选择,软件本身不做归一化,需要自己先处理,工具盒中的TCGA数据归一化工具提供了常用的归一化方法
回答于 2018-01-30 11:17
miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling不区分的,isoform里有3p、5p数据,可用最新版的TCGA简易下载工具V10进行合并提取
回答于 2018-01-30 11:08
下载脚本下来直接跑就行,自己电脑上安装perl及相关的模块
回答于 2018-01-29 17:06
你理解的没有错,综合days to death和days to follow up的,死亡的会登记在days to death,没死亡的登记在days to follow up,然后后面还会有follows_ups,这个相比于days to follow up是最新的,你可以以days to death和days to follow up为准,也可以以days to death和follows_ups_days to follow up为准,相当于存在两个...
回答于 2018-01-29 13:08