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用R中的DESeq2处理tcga下载的数据出现some values in assay are...
DECenterV5版已经更新，没有之前分组因子的问题了，你的这个问题应该是你的表达谱数据中存在一些特殊的值，你检查一下，这不是分组的问题。
回答于 2017-11-15 09:55
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简易TCGA下载工具無法運行
你的电脑不兼容这个版本的下载工具，新版的TCGA简易下载工具会解决这个问题，马上发布了：https://www.shengxin.ren/article/221
回答于 2017-11-14 21:38
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我用这个DECenter就没用成功过，换了各种样本试，都会出现各种错...
你的这个错误主要有两个方面 1、你的软件路径不仅有中文还有（1）这玩意，你把软件放在根目录，文件夹名字用纯英文，不要有空格 2、样本分组，你需要选择你的样本分组比如tissue那一列，但是你那一列里面有各种逗号，双引号等符号你看一下，你手动的编辑一下让其变得简单一些，比如A、B、C、D等简单的单词 以上就能解决...
回答于 2017-11-14 15:15
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DECenter为什么还有这样的错误呢？求助
第一个错误是你的样本分组列没有选对 第二个错误是警告你其中有一个样本名称在表达矩阵中没有，如果继续运行的话会去掉这个样本
回答于 2017-11-14 15:10
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你好，在用RNA-SEQ分析TGCA数据库的时候，在用DE-CENTER分析的时...
你的工具盒的文件路径中包含有中文，R对中文支持不好，你把工具盒的文件路径改成英文就好了
回答于 2017-11-14 10:20