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使用DEcenter出现新错误！
这个问题是你的R包安装有问题，建议你使用工具盒打开R软件，手动安装一下limma: 比如输入： source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite('limma') 或者 source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite('limma')
回答于 2017-11-13 17:19
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使用DEcenter前是否要将芯片表达矩阵进行预处理？
你提取出来的表达矩阵应该是没有合并多个探针对于一个基因的情况，才存在上述问题，如果是GEO下载的数据建议使用GEO数据转换器。
回答于 2017-11-13 17:14
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我查到的表达值是该基因所有转录本亚型表达总和吗？还是其中某哪...
1、Merge_matrix.txt.cv.lnc 和 Merge_matrix.txt.cv文件 前者是lncRNA，后者是编码基因还包括部分非编码的 2、这种情况你直接使用这个转录本ENSG00000213523.8比较好，如果使用转换工具进行转换的话会将多个转录本的表达水平取中位数。
回答于 2017-11-13 09:56
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