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TCGA简易下载工具snp somatic的问题
第一个问题你把右上角的复选框全部不勾选就可以下载全部了 第二个问题我也懵逼，问题太大了。。。。不知道你想问啥。。。。
回答于 2017-10-11 18:07
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在按照生信人网站的一篇文章，做生存分析有不懂得地方
问题1：你需要仔细看一下找到 days to death（死亡的样本就用这个）和最后随访时间（未死亡的就用这个）这两列就行了，详情参考：TCGA临床病理随访资料解读 问题2：R中下标不是从0开始的，从1开始 问题3：你的第一列有重复的名字，你需要找找看哪里重复了，看看为什么重复，酌情处理
回答于 2017-10-11 10:25
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请问通过小工具下载的甲基化数据，那些甲基化cpg位点怎么对应或...
你看看这个问题：https://www.shengxin.ren/question/291
回答于 2017-10-11 10:21
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用下载的GEO数据分析器打开下载好的数据显示“数据解析错误，请检...
你下载的这个数据可以损坏了，你手动试试能否解压，如果不能解压说明文件没有下载全，去重新下载
回答于 2017-10-10 11:33
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祝老师：按照您的方法重新分列了，可以正常选择，但是就是不出来...
你确定你的表格里对应的列是数字吗，你看一下logFC和adj.p.val那两列数据是否是数字
回答于 2017-10-10 09:14
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还有做热图，老提示电脑内存不够，我的内存都还有好几百个G，是...
你的基因太多了，也就是行数肯定超过好几千了，这聚类热图其实是没什么意义的，如果你一定要做，你可以先把RowCluster那个复选框取消勾选就可以了
回答于 2017-10-10 09:13
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使用火山图小工具绘制出图形之后如何根据图中的点找到对应的基因...
在你的表格中筛选一下就可以了，比如红色的点表示上调这些点的p值小于0.05，log2(foldchange)大于1，你用Excel对这两列筛选一下不就得到了嘛
回答于 2017-10-10 09:10
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