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请问有生信方面的培训吗？

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搞生信最简单的流程是什么呢？找差异基因，做GO KEGG PPI？有没有一条明确的套路呢？希望大神们指点指点，生信小白谢谢大家

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从GEO数据库下载下来的甲基化芯片要什么处理呢？下载来的芯片，通过R语言处理后得到了甲基化差异区域，通过注释获取了相关基因。但是我不明白什么这些区域哪些是低表达还是高表达的，对于基因的影响，希望大佬们能帮忙一下，好几天了很绝望啊

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3 我查到的表达值是该基因所有转录本亚型表达总和吗？还是其中某哪一种？

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  • tnt 2018-08-12 22:32

GEO甲基化数据可以用DEcenter转换吗？

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TCGA数据库如何下载circularRNA的数据

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15 有人能帮忙注释一组数据么 注释平台是GPL11154

1 回答
  • K28 2018-09-18 08:25

TCGA 配对样本

1 回答
  • qqqq 2018-07-12 09:22

原始数据标准化以后做的DEG跟原始数据直接做的DEG不一样，做标准化的意义是什么？

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10 请问这样如何转换基因id啊？找不到symbol和normalized···

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选择原文一样的条件，做不出DEG

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10 我在用R语言ConsensusClusterPlus包做共识聚类以后，使用sigclust做聚类效果的评估，为什么不管换什么数据，1类与2类之间的p值总是1呢？

1 回答

通过TCGA简易下载软件下载的RNA数据合并并且转换之后还需要再进行log处理么？

0 回答
  • vida 2020-12-16 21:01

geo数据库中的临床数据怎么下载

2 回答

请问：您有统计基因组序列信息的脚本吗？比如得到它的n50， gc含量，覆盖度等，谢谢

1 回答

TCGA胃癌甲基化数据下载很长时间下载进度是0,是什么原因呢？

1 回答
  • XL 2018-11-19 16:36

ROC曲线上缘达到边界？TP大于1？？

1 回答

5 TCGA 简易小工具下载的CNV 片段数为什么和 官网的数目不一致，是TCGA-STAD 项目

1 回答

5 根据TCGA提供的RNA序列数据做预测的原理问题

0 回答

10 sangerbox

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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