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通过已知物种基因家族（按含每个domain定义）获取另一物种所有同源基因

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  • wu 2019-04-10 01:14

3 title:Identification of invasion‑metastasis‑associated microRNAs in hepatocellular carcinoma based on bioinformatic analysis and experimental validation.

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5 为什么我WGCNA富集到的同一个模块中（比如蓝色模块）的基因既有上调的又有下调的？

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6 运行orthomcl时，orthomclPairs这一步，只有两个物种被聚类了，其他物种在结果文件中根本没有

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3 WGCNA数据input的goodgene

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3 TCGA下载的GBM数据中哪3个文件是somatic mutation，CNV和gene expression，如何把前两者转换成0-1矩阵

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3 谁告诉我这个基因组序列可视化比对的图是怎么做的？拜托拜托

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6 再次出现临床数据合并中的问题。（升级到v13版后已解决）

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snpEff对SNP进行注释，结果列表是errors，并且没有snpEff_genes里是空的

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不常见芯片平台GPL6604

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5 为什么工具下载的TCGA RNA-seq 以及 miRNA-seq 只有癌症样本，而没有正常样本

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  • Lily 2017-11-10 14:22

老师们，这个转换器到底要转换成怎么的表达矩阵才能进入DECenter进行差异分析？这个gene symbol是芯片数据吗，每次都说运行错误

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DEC运行问题

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关于BRIG软件使用

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5 WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试

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10 WGCNA＋Cytoscape

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3 六框翻译

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5 请问GEO数据里面的series matrix，我拿来直接构建机器学习模型，做分类或者特征选择，这种做法有毛病吗？（机器学习模型自带scale）

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大神们，请问如何用linux命令进行序列比对及组装叶绿体，组装软件用的是platanus，有教程么？

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TCGA 差异基因分析用的是RNA-htseq-count数据集，count数可以用来做多因素分析和roc曲线？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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