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5 GISTIC如何在线分析TCGA下载的CNV数据

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  • XL 2018-11-22 10:44

lncRNA的gene symbol有LOC开头的和LINC开头的有什么区别呢？

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用suvival包的survdiff()做生存分析的时候报错，提示只有一个组，麻烦大家帮忙

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癌症驱动基因和癌症驱动突变有何区别和联系？乘客基因和乘客突变有何区别和联系？

2 回答

用GEO芯片数据转换器，选择转换id的列没有Gene Symbol这个选项怎么将ID转成基因呢？

1 回答
  • XL 2018-11-20 13:08

做临床预测模型的ROC曲线为什么是折线呢？

3 回答

问下Gsea和go,kegg 优势在哪，写文章如何取舍

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10 获取TCGA RNA-Seq后如何分离mRNA跟lncRNA

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基因高低表达怎么定义？

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新手提问：如何对一个新获得的基因家族进行家族进化分析

2 回答

8 能否用TCGA中GBM的正常样本和LGG的肿瘤样本合并在一起，然后做差异分析呢？

2 回答
  • qqqq 2018-07-11 11:25

各位大神，低甲基化和高甲基化应该看哪个指标啊，看logfc的符号还是看deltaβ的符号

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10 利用BRIG做基因组圈图，怎么不能显示基因组比对的信息？

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5 求直接单独运行R脚本，处理矩阵，对多个探针的取其平均表达量

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怎样从下载的GEO测序数据当中筛选出lncRNA呢？

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15 TCGA基因表达（HTSeq-FPKM）的样本名称和临床资料（Clinical merge）的样本名称不一样，如何对应？

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3 差异表达基因作图，请问如何做出上面图片的效果，自己做完是下面那个图片

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5 请问怎样通过cds序列比对得到其对应的基因组全长序列，谢谢

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5 TCGA的bam和vcf下载

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  • sixi 2017-08-22 17:21

不同平台和系列的GEO数据整合分析

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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