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5 请问怎样通过cds序列比对得到其对应的基因组全长序列，谢谢

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  • XL 2018-11-26 20:52

misc-RNA能算作lncRNA嘛？

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3 GEO芯片数据无法导出数据矩阵

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5 如何查看几个基因是否在同个通路，以及他们之间是否有联系和影响

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10 各位大神，我分析TCGA数据，某基因mRNA表达在肿瘤转移组低表达，非转移组高表达。 转移组患者生存时间短。但某基因和患者生存无关，这个如何解释？

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  • sixi 2017-08-22 17:21

不同平台和系列的GEO数据整合分析

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怎么验证COX预后模型

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甲基化芯片数据怎么分析（ID没有gene symbol）

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  • XL 2018-11-19 09:36

用survivalROC包做ROC曲线出问题了

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请问TCGA用lasso做预后模型，用GEO验证，结果验证组risk全是低风险组，是不是TCGA和GEO两个数据要先做处理，“统一”化？TCGA是从UCSC上下载的

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3 我筛选出1000多个差异表达的lncRNA，做了批量生存分析之后，结果文件里只有400多个lncRNA了，这种情况正常吗？筛选的标准是什么？

1 回答

使用TCGA简易工具下载breast的solid tissue normal的CNV数据，里面分为grch38.seg.txt和nocnv_grch38.seg.txt，想问一下这两个格式的文件有什么区别？我想做一个不患乳腺癌的reference，需要用到什么文件呢？

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3 请问有没有大神用过mVISTA?输入文件里边的注释文件怎么生成吖？

1 回答

基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？

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TCGA数据，不同肿瘤的数据是否可以合并分析

2 回答

15 DAVID中结果出来了在哪里查看上调基因、下调基因、肿瘤相关基因

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5 WGCNA分析的数据问题和表型相关性问题

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3 如何筛选出某一单基因高表达的肿瘤样本中的差异表达基因？

1 回答

什么是adaptor sequences and quality trimmed reads ？

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TCGA 下在某一癌型的甲基化数据（450K 平台），如何判断、筛选那些是启动子区域的甲基化位点哈……

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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