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请问在TCGA数据库中下载乳腺癌的基因表达谱数据时，在同一个文件夹中为什么会同时出现TCGA-A7-A0DC-11A-41R-A090-13(正常)和TCGA-A7-A0DC-01A-11R-A010-13（肿瘤）那到底这个TCGA-A7-A0DC样本是正常的还是患病呢？

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10 如何下载kegg数据库的KGML的xml文件？

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请教：同一个基因对应多个探针名，想取个平均值

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miRNA-Seq-BCGSC miRNA Profiling（ISOFORM）下载合并文件后merge-matrix里没有数据，怎么办啊？

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GSEA分析结果中UP/DN的影响？恳请大侠解答，qq745081152，hjz005@163.com

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TCGA下载工具检索的RNA-seq-HTseq-FPKM与RNA-seq-HTseq-FPKM-counts和RNA-seq-HTseq-FPKM-UQ有什么区别？

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用GEO2R在线分析结果准确吗？同一个数据集为什么每次分析的探针数量都不一样？

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  • gy 2017-07-06 09:57

用简易TCGA下载工具，clinicalFull出错，显示“合并提取所有临床随访信息出现错误，请检查文件”

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TCGA临床数据提取后那些“938、854”这些数字（如图）代表什么意思？

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TCGA甲基化下载问题

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Z score

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  • lily 2017-10-10 11:00

用下载的GEO数据分析器打开下载好的数据显示“数据解析错误，请检查导入数据格式”请问是什么问题？

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15 临床数据前后列不一致

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  • tnt 2017-11-27 15:57

DECenter转换数据，报错：是否正确运行：否 输出信息：b'ERROR : contrasts can be applied only to factors with 2 or more levels \r\n' 错误信息：无 运行出错，请检查你的数据！

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请问MINiML formatted family file(s)这个格式的文件，是标准化过的吗？看和raw data数值不一样，那么请问生信工具盒里DEcentre的转换用limma,这个是对他做了什么操作呢。谢谢您

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TCGA简易下载工具能不能下载临床数据？

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3 使用PennSeq报错：ValueError: invalid contig `chr8_KI270816v1_alt`

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审稿意见说logrank曲线有交叉，如何解决

2 回答

20 TCGA建立COX回归模型用GEO验证失败

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  • jill 2019-04-15 22:05

GEO便捷转换器导出数据矩阵是空文档，没有提示导出失败也没有提示导出成功，样本矩阵是导出成功的，电脑内存应该也是够的，请问这要怎么解决呢？谢谢各位大佬！（截图一直上传不成功请见谅）

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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