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一键式WGCNA使用的时候，为什么表型不是我所规定的的表型，而是Random1、Random2呢？

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请问WGCAN软阈值自动选为1，R^2还有负值，这是什么原因？

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  • Dony 2019-01-07 15:15

unable to find an inherited method for function ‘probeNames’ for signature ‘"matrix"’

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  • XL 2018-11-24 11:00

进行lncRNA重注释选择两数据库重叠基因，但基因名不同怎么办？

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WGCNA分析性状构建

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3 megahit 组装报错Cannot identify read library type，如何解决？

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请问在TCGA数据库中的RNA-seq中下载的mRNA基因表达谱数据是芯片数据还是测序数据，谢谢

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WGCNA 软阈值报错，看不懂，请大神指点

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安装Python出错，环境赋予不了，请大神指点

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批量生存分析 KM曲线分位数和均值 应该选哪种

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5 生信工具盒里面的批量生存分析工具，按照教程运行12个小时结果都没出来，请老师帮我看看，谢谢

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从公众号看到的:“ 简易TCGA下载工具-V8”这个软件，小编说在生信人社区上可以下载，怎么没有找到

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运行sangerbox的DECenter时报错

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老师们好，用火山图绘制软件，数据导入后，点击绘图，可是软件没有反应，麻烦老师了，感谢。

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WGCNA中，如何将训练集中产生的模块特征基因（ME）应用于测试集，进而进行生存分析？

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罕见ID转换问题

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TCGA临床信息

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5 请问一下，问题1：我用GEO芯片转换器对GSE69925数据集进行提取数据，经提取后，得到的基因list, 如何对其进行lncRNA进行批量提取？问题2：为什么有的GEO芯片平台（比如GPL18109)，在用GEO转换器对“选择转换ID的列”下拉菜单里，没有Gene symbol这一条目，如何解决？多谢！

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我想咨询一下关于TCGA上CNV数据一些问题。我找的是breast的样本，但是我想通过breast的癌症级别对样本进行分类。我用了tumor stage作为分类标准，目前下载的样本有120多个，分了十几个tumor stage，有的tumor stage里的样本数才两个，想着不同tumor stage之间有没有可以合并的。不知道我整体的做法是否正确，求大神们助攻，谢谢!

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DECenter:简便的差异分析工具

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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