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5 生信工具盒里面的批量生存分析工具，按照教程运行12个小时结果都没出来，请老师帮我看看，谢谢

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怎么从TCGA下载的数据中提取lncRNA的信息？求详细步骤，恳请大侠指点详细步骤

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  • Dony 2019-01-07 15:15

unable to find an inherited method for function ‘probeNames’ for signature ‘"matrix"’

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5 请问一下，问题1：我用GEO芯片转换器对GSE69925数据集进行提取数据，经提取后，得到的基因list, 如何对其进行lncRNA进行批量提取？问题2：为什么有的GEO芯片平台（比如GPL18109)，在用GEO转换器对“选择转换ID的列”下拉菜单里，没有Gene symbol这一条目，如何解决？多谢！

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GSEA分析结果中UP/DN的影响？恳请大侠解答，qq745081152，hjz005@163.com

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运行sangerbox的DECenter时报错

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3 megahit 组装报错Cannot identify read library type，如何解决？

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TCGA下载工具检索的RNA-seq-HTseq-FPKM与RNA-seq-HTseq-FPKM-counts和RNA-seq-HTseq-FPKM-UQ有什么区别？

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罕见ID转换问题

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3 请问染色体之间的hic互作热图用什么软件可以绘制？

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请问在TCGA数据库中的RNA-seq中下载的mRNA基因表达谱数据是芯片数据还是测序数据，谢谢

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WGCNA 软阈值报错，看不懂，请大神指点

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GEO数据的CDF文件下载不了

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  • XL 2018-11-24 11:00

进行lncRNA重注释选择两数据库重叠基因，但基因名不同怎么办？

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lncRNA重注释问题

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用DECenter的时候软件提示不存在叫'limma'这个名字的程辑包 ERROR : unable to install packages 怎么办啊

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批量生存分析 KM曲线分位数和均值 应该选哪种

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请问MINiML formatted family file(s)这个格式的文件，是标准化过的吗？看和raw data数值不一样，那么请问生信工具盒里DEcentre的转换用limma,这个是对他做了什么操作呢。谢谢您

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WGCNA

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3 批量生存分析工具结果中，匹配上234个样本，但是生存曲线中低表达组N=14，高表达组N=13，请问为何匹配样本数和高低表达组样本数差很多？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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