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TCGA简易下载工具得到TCGA_LIHC_Merge数据可以直接用来做GSEA分析吗？还是需要转化为TPM呢？谢谢！

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3 有人做过TCGA和GEO数据的对应整合吗

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TCGA简易下载工具v14中的甲基化数据和CNV数据下载后，都是转化好的基因水平的矩阵吗

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下载TCGA的mRNA数据，里面很多数值是什么

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  • mz 2018-04-27 19:54

tcga RNA-Seq数据为RPKM，不是FPKM，可以用RPKM算生存期，差异表达吗

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GEO2R产生的差异序列，下载excel表格后，如何做热图？

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5 TCGA中基因表达数据的差异太大，可否删去离群值，便于作图

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GSEA结果解读遇到问题，求解答，谢谢！

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COBERSORT 网页版无法正常上传数据，R包申请无回复。求R包或者其他解决办法

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为什么TCGA简易数据库ENSG_ID转换得到的基因数和在Ensembl转换得到的数量不一样？

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请教16S高通量测序结果分析流程

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GEO数据库中的芯片数据txt文件（比如GSExxxx_series_matrix.txt）都是已经log化后的数据吗？

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GPL570同一个平台下，准备分析9套数据，是否可以RAW原始数据合并？

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mega做功能基因进化树分支概率低

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3 limma包进行探针注释时GPL570_HG-U133_Plus_2_201410030.txt文件不知道去哪下

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热图下面的min和max是什么意思啊？

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WGCNA分析， 基因表达文件中，有2万个基因，如何进行选取？是根据方差？还是选取差异表达的基因做WGCNA?

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您好，GEO数据库下载下来的数据集怎么区分出mRNA跟lncRNA？有没有什么工具可以用？

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最新DECenter差异分析limma包加载不了怎么解决？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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