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有没有简易网页或工具可以使用METABRIC乳腺癌数据库？

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3 sangerbox里GEO转换工具上传xml文件后报错

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  • Pham 2018-05-26 06:46

生信小工具中的批量生存分析的KM结果与SPSS的KM结果相差很大

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DECenter分析差异基因提示rowname重复，怎么处理？

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GSEA分析无反应（使用了msigdb C2数据集）

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GEO便捷转换器错误

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10 请问wgcna分析中制定模块的找hubgene的代码？

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TCGA数据 与 GEO数据 可以整合在一起用批次处理吗

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多因素生存、回归分析结果的系数、公式在哪里？

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3 批量生存分析工具结果中，匹配上234个样本，但是生存曲线中低表达组N=14，高表达组N=13，请问为何匹配样本数和高低表达组样本数差很多？

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3 请问TCGA中，miRNA的原始数据是哪个? 类似于htseq-count数据

0 回答

祝老师您好，我用TCGA的FPKM数据用CIBERSORT进行分解然后分组，再用组标签做生存分析时，得到的P值很大，分不开。我不确定是CIBERSORT的去卷积效果不好还是聚类的效果不好，以你的经验CIBERSORT的去卷积结果好吗，能得到好的实验结果吗

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经GEO芯片转化器后，很多基因名有斜杆，这个怎么处理？

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  • Meng 2018-12-20 09:28

如何打开过大的txt文件，下载了TCGA的甲基化数据，合并后文档大于3G，无法用excel打开~请教用R语言提取其中个别基因的甲基化信息，感谢！

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GEO数据库RNA测序数据分析

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怎样知道目的基因在研究组织中是高表达，还是低表达。

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3 生存分析样本要求

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WGBS,使用bismark,调用bowtie2，执行错误(ERR): bowtie2-align died with signal 11 (SEGV)

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小鼠做GSEA分析。用的是GSEA软件。请问我表达数据有16000多个，但是小鼠的gmt只有14000多，老是报错，咋办啊？

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RNA-Seq数据进行ID转化，许多基因转不出来，用以前的版本是可以做出来的，是版本的问题还是矩阵处理有问题

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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