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10 我在用R语言ConsensusClusterPlus包做共识聚类以后，使用sigclust做聚类效果的评估，为什么不管换什么数据，1类与2类之间的p值总是1呢？

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  • No.4 2019-04-15 18:36

GEO数据库中的MINiML和series matrix

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有关TCGA临床数据下载的问题

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  • K28 2018-09-18 08:25

TCGA 配对样本

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5 gsea分析工具总是提示样本分组错误

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用癌组织和癌旁组织找出来的差异基因能说明什么问题呢？能用于区分癌症病人和正常人吗？谢谢

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10 DEcenter 差异分析小工具报错

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祝老师您好，想请教下用筛选到的所有差异基因做WGCNA计算TOM，总是出现NAN，但若先中数排序挑前N个做就不会有这种情况，是因为差异基因里有太多极小的FPKM值吗？那以什么原则来剔除数据呢？

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GATK的HaplotypeCaller能不能做somatic（cancer）variant discovery呀？虽然官方推荐使用MuTect2，但是我不太懂其中道理

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请问RNA-seq得到了了各样本的counts矩阵，如何计算TPM，谢谢了

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请教一下TCGA下载的CNV数据如何整合在一起？

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问一个简单的问题：基因间隔区是什么意思？可以被转录么？

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运行sangerbox的DECenter时报错

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GEO芯片

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GEO芯片数据转换器能否选择部分样本进行分析？

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如何通过GEOProfiles数据库分析不同类型前列腺癌中 STK11的 mRNA 表达水平？

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3 关于DECenter分析差异表达的错误

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“WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试！”

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生信盒子中的具体小程序启动不了

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  • ucco 2017-10-18 08:20

DEC分析miRNA数据，方法选择limma包吗

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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