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请问GEO数据做DEcenter差异分析，edgR出现“ERROR : negative counts not supported ”，什么原因？

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  • titi 2018-03-28 11:57

3 如何对肝癌数据做Fold Change

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请教一下TCGA下载的CNV数据如何整合在一起？

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问一个简单的问题：基因间隔区是什么意思？可以被转录么？

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RNA-seq分析中怎么把FPKM的数据批量转换成TPM

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GATK的HaplotypeCaller能不能做somatic（cancer）variant discovery呀？虽然官方推荐使用MuTect2，但是我不太懂其中道理

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5 GSEA工具

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3 sangerbox 下载GEO数据无法连接数据库

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ROC曲线

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10 我在用R语言ConsensusClusterPlus包做共识聚类以后，使用sigclust做聚类效果的评估，为什么不管换什么数据，1类与2类之间的p值总是1呢？

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GEO数据转换器转换的文件用EXCEL打开就提示这样，怎么解决啊？

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TCGA的转录组数据能用于GESA分析吗？

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为什么GEO数据转换最近都显示错误，是下载吗文件有问题，之前下载的都没问题

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请问：您有统计基因组序列信息的脚本吗？比如得到它的n50， gc含量，覆盖度等，谢谢

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3 GSEA软件分析相关的问题

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  • lee 2017-11-19 21:03

批量生存分析工具结果如何解读？

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祝老师您好，想请教下用筛选到的所有差异基因做WGCNA计算TOM，总是出现NAN，但若先中数排序挑前N个做就不会有这种情况，是因为差异基因里有太多极小的FPKM值吗？那以什么原则来剔除数据呢？

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boxplot运行成功后只有txt,没有图片

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3 GEO数据

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firehose与TCGA下载数据不一致

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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