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GEO数据分组

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我下载的火山图软件实在不能用，由于有数据要处理，哪位大神帮我处理一下，谢谢，汇报用。

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生存分析做出来的曲线高低表达各三条

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祝老师您好，我用TCGA的FPKM数据用CIBERSORT进行分解然后分组，再用组标签做生存分析时，得到的P值很大，分不开。我不确定是CIBERSORT的去卷积效果不好还是聚类的效果不好，以你的经验CIBERSORT的去卷积结果好吗，能得到好的实验结果吗

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芯片重注释之后，发现探针对应的基因不唯一

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  • zuby 2019-12-12 18:47

limma包运行时提示没有DGEList函数

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在线功能富集分析工具除了DAVID网站外，还有哪个网站啊？

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10 在TCGA数据库中GBM miRNA数据中只有5个，但是我在文献上看到他们的数据有500多例，想请大神们研究一下，不胜感激！！

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生信盒子批量生存分析的p值与graphpad的P值不一样？？？

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  • jill 2019-03-30 23:59

TCGA ID转换后部分ID转换不了，转换导出是空白文档，请问这要怎么解决呢？转换导出是到merge.txt中还是另建新的txt文档呢？谢谢大佬！

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怎样知道目的基因在研究组织中是高表达，还是低表达。

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15 老师，求助！为什么 批量生存分析里 置信区间出现小于零，绝大部分普遍认为的癌基因HR均小于1

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3 GEO数据

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一键WGCNA运行后显示“导出成功”，但是Report.html中一直提示“WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试！”

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请教老师：我一共找到4个GSE数据集，分别以GSE1、GSE2、GSE3、GSE4代替，其中GSE1、GSE2、GSE3是同一个GPL，GSE4是另外一个GPL, 我该怎么分析？把GSE1、GSE2、GSE3提取原始数据，合成一个，然后与GSE4分别计算差异基因，二者取交集？谢谢

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生信人问答平台专家认证时出现413 Request Entity Too Large错误怎么办

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通过RNA_seq测序数据是否可以推算出基因的外显子突变信息

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  • xixi 2019-01-21 18:20

TCGA简易下载工具一直显示正在检索

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ENSG_ID全部带有小数 例：ENSG00000242268.2 是把小数点连同小数点后面的一起去掉就可以了吗？

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GSEA出了很多文件，不知道哪个才是有效的

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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