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3 GEO数据

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芯片重注释之后，发现探针对应的基因不唯一

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15 老师，求助！为什么 批量生存分析里 置信区间出现小于零，绝大部分普遍认为的癌基因HR均小于1

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  • xixi 2019-01-21 18:20

TCGA简易下载工具一直显示正在检索

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简易TCGA下载工具，运行报错

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5 怎么利用TCGA的数据，分析A基因在B基因高表达组和低表达组的表达水平？

3 回答

一键式wgcna运行后无结果

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想问一下，用小工具下载的RNA-seq数据的平台是什么，是IlliuminaHiSeqV2吗？是三级数据吗

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3 sanger box 环境配置Java和Rscript都要配置吗？

2 回答

sangerbox为什么无法安装

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gpl5175 注释文件没有gene symbol，该怎么用？

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TCGA小工具合并文件功能

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GSEA出了很多文件，不知道哪个才是有效的

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10 Decenter分析TCGA差异基因

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3 我查到的表达值是该基因所有转录本亚型表达总和吗？还是其中某哪一种？

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通过RNA_seq测序数据是否可以推算出基因的外显子突变信息

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盒子中便捷ID转换器中的背景文件，是什么?文件格式及如何选择？

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GEO 下载工具输出的表达值是经过normalized 吗？使用limma分析还需要RMA，mas5处理吗

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RNA-Seq差异基因分析

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3 多个相同平台芯片原始数据RMA标准化后转换探针生成的表达矩阵无法应用boxplot绘图是怎么回事？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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