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得到的甲基化差异基因有一万多怎么找到比较好的做富集分析

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HeatmapCluster工具使用案例具体操作问题

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  • K28 2018-09-18 08:25

TCGA 配对样本

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关于TCGA中GBM数据的使用

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dec.exe已停止工作，出现了一个问题，导致程序停止正常工作。DECenter用不了，怎么办？

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请问Win7系统下如何安装使用TCGA2STAT-R 包？

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10 sangerbox

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5 微信公众号提供的ICGC提取代码存在bug？

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WGBS,使用bismark,调用bowtie2，执行错误(ERR): bowtie2-align died with signal 11 (SEGV)

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GSEA分析

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  • oscarwang 生信一期  星标用户 2017-05-25 13:44

TCGA数据库中无法下载SNV的数据

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TCGA简易数据库转换的时候，是ENSG_ID最后一位要加上1再去biomart转换？如：ENSG00000111224.12转换为gene名的时候将ENSG00000111224.12变为ENSG00000111224.13才转换，只有这样才能得到工具转换出来的结果，为什么加上1呢？

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DECenter运行出错

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10 hisat2+stringtie+ballgown得出的结果出现两个相同基因的FPKM值，如何处理？

1 回答

请问，TCGA标准化化后的反相蛋白质阵列基因芯片( RPPA)数据如何下载？

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  • ltzg 2017-08-14 00:14

gwas QQ图所有的点都在预测线上方

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3 老师们，GEO数据转换器里ID没有gene symbol

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请问有生信方面的培训吗？

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5 做生存分析时遇到画ROC曲线的问题。

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3 生信分析时，做表达差异分析基因去重步骤出现R报错

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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