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生信人工具盒里的TCGA下载小工具里下载的临床数据GSE编号是多少可以知道吗？

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从GEO数据库下载下来的甲基化芯片要什么处理呢？下载来的芯片，通过R语言处理后得到了甲基化差异区域，通过注释获取了相关基因。但是我不明白什么这些区域哪些是低表达还是高表达的，对于基因的影响，希望大佬们能帮忙一下，好几天了很绝望啊

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生信工具盒打开数据转换一直提示网络连接异常，下载不了

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3 为什么TCGA小工具下载的数据显示比数据库中的少？

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火山图左侧重叠，怎么办

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  • GOCE 2018-03-15 22:24

DEcenter分析TCGA miRNA差异表达是无反应

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  • ucco 2017-10-18 08:20

DEC分析miRNA数据，方法选择limma包吗

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老师，您好，tcga lihc id转换开始分析用的是旧版的，得到24000左右的基因然后分析投稿被修回；试用新版的取蛋白编码基因只得到19000多。旧版的可以使用吗？差了几千个基因差别是在哪里呢？

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5 寻找目标基因和EMT相关基因的关系

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外显子测序的从头分析流程--突变

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按照步骤，DEcenter显示错误，请老师帮忙看看，指导一下。

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3 关于DECenter分析差异表达的错误

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各位老师好，我这遇到deseq包问题，中间不报错而卡住。

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求推荐一款看Sanger峰图的软件

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SangerBox无法启动

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  • hsm 2018-01-04 22:05

我导入到GEO小工具里时，出现数据解析错误，要我检查数据格式，可是我是下载的MINIML格式啊？

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生信人工具盒32bit没有“GEO芯片数据转换器”

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  • leon 2018-02-01 18:47

3 boxplot中加上表达量的points

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想问下大家跑R都是直接用自己的电脑么

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call SV(结构变异)的工具/软件

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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