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请问有预测已定的某个microRNA的哪个长非编码RNA作为其ceRNA的网站或是工具吗

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用小提琴图来可视化基因差异表达之美化过程

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从批量生存分析导出的文件，我想把它导入到R软件用生存包做生存分析，但是文件一直导入不进去，一直显示复原文件幻数出错，文件可能有损坏

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批量生存分析TCGA数据不匹配的问题

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你好，请问我用TCGA下载工具下载RNA-seq后，合并文件总是报错，将fileID分件分成几段或者重新下载数据也还是报错。要如何解决？

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请问单因素生存分析工具中，最佳cut off是如何决定的？

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关于DECenter结果导出问题

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老师，您好！请问用edgeR分析后的差异基因是基于什么原则排序的呢?谢谢！

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DEC中统计方法的选择？

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祝老师，我走hisat2+featurecounts+DESeq2得到count矩阵，对ensemble ID进行symbol转换时，存在多个ID对应一个symbol的情况，请问count矩阵应该怎么合并基因count表达值，有代码可以参考吗？

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3 用TCGA经分析后的提取的基因，然后在GEO中进行验证，两个平台的文件用什么方法进行标准化

1 回答
  • hty 2018-01-27 15:21

rna seq counts数据，进行差异分析，需要归一化么？

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请问有ICGC的下载和TCGA一样是公开免费的吗？

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请教一下，生存分析是为什么一直出现以下的情况，我的时间是月，它还是会一直提示？而且提示样本没有匹配，可是检查数据都是匹配的样本？急，求指导

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使用DECenter反复出现“请检查数据和日志”的报错

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3 老师：生信工具盒的DECenter显示:error:dim(X)的值必需是正数,这该怎么处理呢？

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使用Sanger BOX中DECenter出现以下错误是怎么回事？

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10 DE Center可以分析到差异基因，但是差异基因的矩阵始终得不到，就是“Top”文件始终没有内容在里面，所以没办法做热图。

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TPM后不能关联fileID

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  • dean 2018-10-18 17:44

SeqMap序列比对时提示序列不匹配存在非法碱基

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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