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3 请问样品相关系数用的基因原始数据，是否要取log2

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5 miRNA数据合并后有两个文件：miRNA Profiling.isoform.merge.count.txt和miRNA Profiling.isoform.merge.txt，如何选择使用呢？

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请问在线版的sangerbox里现在TCGA数据时只有肿瘤组织没有癌旁组织吗？

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祝老师 您好 我想请问为什么我在TCGA上下载的转录组数据合并之后打开tag那一行全都是MMRF_2106-null MMRF_2122-null MMRF_1593-null 这一种 这种类型的我无法判断是肿瘤还是正常组织？请问 是我哪里出错了吗 期待您的解答 谢谢

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老师 您好 我想请问为什么我在TCGA上下载的转录组数据合并之后打开tag那一行全都是MMRF_2106-null MMRF_2122-null MMRF_1593-null 这一种 这种类型的我无法判断是肿瘤还是正常组织？请问 是我哪里出错了吗 期待您的解答 谢谢

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  • zty 2020-08-25 07:21

老师您好，通过v16下载miRNA Profiling ISOFORM，合并后得到两个文件如下图，count之外的文件是FPKM数据吗？

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20 GEO数据集中组织样本的表达矩阵可以和细胞表达矩阵合并吗？

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5 请问对于小RNA测序来说，如何分析piRNA呢？我将与rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA，scRNA，miRNA比对之后剩下的序列与piRBase数据库的序列用bowtie比对之后的，接下来该如何做，怎么接着定量呢？没有注释文件，怎么用htseqcount定量呢？求好心人赐教，已经卡了半个月了

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10 TCGA 成熟体miRNA数据（isoform）为什么同一肿瘤内的不同样本的miRNA数目不一样

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一键式WGCNA，WGCNA的简易便捷分析软件

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为什么sangerbox下载不到TCGA的数据

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  • DoL 2020-06-30 22:13

seqmap序列比对工具 求软件

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  • LYL 2020-06-21 16:15

GEO芯片数据转换器表达矩阵为0

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3 SangerBox里面的WGCNA小工具，为什么我导入后得到的结果里面，表型总是“Random1”和“Random2”，样本信息里的表型根本就没有出现？

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3 从http://sangerbox.com/TcgaDown下载的转录组表达矩阵（已转换id），但请问怎么提取miRNA、lncRNA、mRNA？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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