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FPKM多大才认为这个基因是表达的？

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5 RNA-seq的fpkm数据应该用什么差异分析方法？

1 回答

RNA-Seq数据生存分析时分组，高表达（High）和低表达（Low）是怎么确定的？

1 回答

生存分析所得p值与生存曲线logrank值不同

1 回答

10 请问差异基因分析的小软件中，出来的结果logFC是log2FC吗？

3 回答
  • ZaCH 2017-11-17 20:57

3 TCGA差异分析发现某些基因在肿瘤组织中低表达，但生存分析发现肿瘤中高表达的预后差，怎么解释呢？

1 回答

RSEM 和 RPKM的差别，及原理

1 回答
  • sean 2018-08-11 00:39

如何区分TCGA下载文件是癌组织还是癌旁组织？

2 回答

gpl5175 注释文件没有gene symbol，怎么该怎么用

4 回答

3 老师你好！我想用tcga mRNA数据估算肿瘤微环境中细胞相对含量，比如通过CIBERSORT、MCPcounter等工具进行转换，输入矩阵用counts，FPKM还是TPM数据啊？

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  • ZaCH 2017-11-01 22:38

5 请问怎么对GEO芯片重注释提取lncRNA

1 回答
  • Star 2018-02-22 17:58

如果要比较T vs NT某基因表达量的差异，应该用FPKM还是FPKM-UQ

1 回答

5 cBioportal中的mRNA Expression z-Scores如何理解？

2 回答

5 无参转录组组装后较短，怎样用CEGMA评估？

2 回答
  • lee 2017-09-02 15:09

3 请教大家，转录组RNA-seq 差异表达分析R语言代码

3 回答

15 TCGA简易下载工具RNASeq的htseq-count数据是你们自己根据rsem值转换而来的？

1 回答

10 得到基因的想问一下 已经拿到了基因的COG注释，NR注释,SWISSPROT注释,KEGG注释,GO注释,INTEPRO注释 怎么进行下一步功能预测

0 回答
  • wang 2020-11-14 03:19

ERROR : dim(X)的值必需是正数

1 回答

10 关于DESeq和edge R做差异表达的一些疑问

1 回答

GSEA输入数据是RNA-seq，应该是fpkm还是counts，需要做预处理吗

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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