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挖挖
2017-11-23 21:06
FPKM多大才认为这个基因是表达的?
FPKM
2
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15910
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babybanana
2018-09-21 16:27
5
RNA-seq的fpkm数据应该用什么差异分析方法?
1
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15246
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taodan2003
2017-11-03 23:05
RNA-Seq数据生存分析时分组,高表达(High)和低表达(Low)是怎么确定的?
生存分析
1
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15065
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tangyoyoyo
2018-07-17 22:51
生存分析所得p值与生存曲线logrank值不同
生存分析
1
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14587
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小吴吴
2018-11-29 19:00
10
请问差异基因分析的小软件中,出来的结果logFC是log2FC吗?
差异基因分析
1
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12295
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land_fly
2017-09-08 22:20
RSEM 和 RPKM的差别,及原理
RNA-Seq
3
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12020
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ZaCH
2017-11-17 20:57
3
TCGA差异分析发现某些基因在肿瘤组织中低表达,但生存分析发现肿瘤中高表达的预后差,怎么解释呢?
基因差异
生存分析
1
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11537
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sean
2018-08-11 00:39
如何区分TCGA下载文件是癌组织还是癌旁组织?
TCGA下载
4
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10811
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Jingxin Jiang
2018-09-13 11:28
3
老师你好!我想用tcga mRNA数据估算肿瘤微环境中细胞相对含量,比如通过CIBERSORT、MCPcounter等工具进行转换,输入矩阵用counts,FPKM还是TPM数据啊?
TCGA
CIBERSORT
2
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10445
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Dr_grass
2018-06-04 17:10
gpl5175 注释文件没有gene symbol,怎么该怎么用
GEO
2
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9797
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ZaCH
2017-11-01 22:38
5
请问怎么对GEO芯片重注释提取lncRNA
重注释
lncRNA
1
回答
9368
浏览
Star
2018-02-22 17:58
如果要比较T vs NT某基因表达量的差异,应该用FPKM还是FPKM-UQ
FPKM
1
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9207
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弗里曼熊
2018-06-04 18:13
5
cBioportal中的mRNA Expression z-Scores如何理解?
TCGA
2
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8872
浏览
lihuanyong
2017-06-01 14:32
5
无参转录组组装后较短,怎样用CEGMA评估?
CEGMA
2
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8347
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lee
2017-09-02 15:09
3
请教大家,转录组RNA-seq 差异表达分析R语言代码
3
回答
7924
浏览
Keryruo
2017-06-25 19:12
15
TCGA简易下载工具RNASeq的htseq-count数据是你们自己根据rsem值转换而来的?
TCGA简易下载工具
1
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7773
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夏目三三
2017-08-24 21:04
10
得到基因的想问一下 已经拿到了基因的COG注释,NR注释,SWISSPROT注释,KEGG注释,GO注释,INTEPRO注释 怎么进行下一步功能预测
基因注释
COG
GO
KEGG
1
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7557
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陈东君
2017-08-03 15:23
10
关于DESeq和edge R做差异表达的一些疑问
DESeq
edgeR
TCGA
FPKM
0
回答
7490
浏览
wang
2020-11-14 03:19
ERROR : dim(X)的值必需是正数
2
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7305
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ZaCH
2017-11-21 20:05
3
下载TCGA counts数据后用EdgeR做差异分析,后续如果计算lncRNA与mRNA表达的相关系数,是用哪种数据呢?
TCGA
相关系数
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