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ggrepel-解决散点图样品标签重叠，方便筛选样品

ggrepel解决标签之间重叠问题简介 有时样本比较多，而我们想在图形中添加标签的时候，容易出现标签遮盖的问题。 尤其是在扩增子研究中，在相同基因型、环境条件宿主(温室植物、饲养动物)至少...

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• 刘永鑫 发布于 2018-01-02 20:14

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ggbiplot-最好看的PCA作图：样品PCA散点+分组椭圆+变量贡献和相关

写在前面 https://github.com/vqv/ggbiplot/blob/master/README.md 前几天在《宏基因组0》微信讨论群看到了有人发了一个上面链接，点开一看居然是一条命令出帅图，真是太实用了。我立即使用本...

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• 刘永鑫 发布于 2017-12-23 09:27

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你想要的生物信息知识全在这——生信宝典文章目录

程序学习心得 生物信息之程序学习如何优雅的提问生信宝典视频教程好色之旅-画图三字经转录组分析的正确姿势学习生信的系列教程学习生信的系列书籍教师节献礼 - 文章用图的修改和排版简单强大的...

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• 刘永鑫 发布于 2017-12-10 11:55

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怎么下载R的老版本

今天为了使用一个R包的缘故，试了好多个R版本，终于安装上 笑哭 那么问题来了，怎么下载老版本的R呢 嗯，记住这个链接：https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/ 所有的版本的R都...

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• 祝让飞 发布于 2017-11-02 15:05

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在R语言中关于目录的问题小结

在敲了很多R脚本，然后需要互相引用的时候就会遇到路径问题了 1、如果获取当前工作目录使用： getwd() 2、获取R 包安装目录使用: .libPaths()[1] 3、获取R脚本当前目录咋整？ 这个问题其...

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• 祝让飞 发布于 2017-09-30 15:13

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用小提琴图来可视化基因差异表达之美化过程

为了表示基因在样本中的差异，对于许多个基因的话用火山图感觉挺高大上的，那么对于少数几个基因的话一般用什么来展示其表达差异呢，有很多种办法，比如箱线图，柱状图等等，今天主要用小提琴图来可视化几个基因的差异表达。

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• 祝让飞 发布于 2017-07-03 21:09

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那些年画过的热图之pheatmap美化过程

在基因的表达模式分析中，我们往往需要对多个基因表达数据进行可视化处理，使得我们所关注的基因在不同样本中表达情况一目了然。在日常研究中，我们往往习惯于选择热图实现这一基因表达模式可视化的需求，进而直观的表述我们的基因表达模式的分析结果。

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• 祝让飞 发布于 2017-06-26 20:57

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R语言做主成分分析实例

主成分分析法是数据挖掘中常用的一种降维算法,是Pearson在1901年提出的,再后来由hotelling在1933年加以发展提出的一种多变量的统计方法，其最主要的用途在于“降维”，通过析取主成分显出的最大的个别差异,也可以用来削减回归分析和聚类分析中变量的数目，与因子分析类似。

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• 祝让飞 发布于 2017-06-01 12:37

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R语言可以这么玩 |高质量图片这样导出！

众所周知，可视化是统计中不可缺少的一部分，也是很直观的传递信息的一种方式，并且SCI文章投稿最重要的也是对于图片的处理。 一般杂志对图片要求：图片最低分辨率300DPI，部分杂志要求不低于6...

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• 易统计 发布于 2017-05-17 14:04

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• 易统计 发布于 2017-05-17 14:04

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R语言可以这么玩 |绘制地图与地点数据可视化

本期是我们R语言可以这么玩系列第四期。 小蟹君今天又来给大家介绍R的玩法了。这次，我们用R来画地图吧，利用可视化工具，我们更能轻松地得出结论哦~

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• 易统计 发布于 2017-05-02 10:46

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R语言可以这么玩 |可视化中文分词和词频统计！~

中文分词，R语言也可以搞定！~

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• 易统计 发布于 2017-04-24 15:33

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R语言一箭绘心

如何利用R语言中的arrows进行心的绘制。

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• SXR 发布于 2017-03-28 20:38