乳腺癌 - 生信人

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生信文章解析（第六篇）揭示MuBC的分子结构

通过研究MuBC和IDC样本之间基因表达，拷贝数和突变水平的差异，揭示MuBC的分子结构，表明MUC2基因的DNA甲基化异常可能是MuBC胞外粘蛋白产生的原因。

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柚子发布于 2019-08-15 10:24

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生信文章解析（第一篇）在乳腺癌中，MAPK通路的突变驱动扰动与肿瘤内免疫反应负相关？

基于免疫相关基因对乳腺癌样本重新划分具有不同免疫表型的病人，从多组学的角度刻画这些不同免疫表型病人的特征。

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柚子发布于 2019-07-30 10:21

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两篇文章一字之差，影响因子差了三倍，他们都干了啥？（第二篇）

话不多说先上图：最近在写工具盒里WGCNA工具的使用教程，检索素材时发现了一篇文章，哦不，是两篇，他们长的几乎一样，且看： Prognostic Genes of Breast Cancer Identified by Gene Co-e...

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祝让飞发布于 2018-10-16 16:27

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两篇文章一字之差，影响因子差了三倍，他们都干了啥？（第一篇）

话不多说先上图：最近在写工具盒里WGCNA工具的使用教程，检索素材时发现了一篇文章，哦不，是两篇，他们长的几乎一样，且看：Prognostic Genes of Breast Cancer Identified by Gene Co-exp...

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祝让飞发布于 2018-10-16 16:19

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手把手教你从TCGA乳腺癌的表达谱样本中提取出三阴性的样本的表达矩阵

刚好在做课件是有同学问怎么搞到三阴性乳腺癌的表达谱数据，故有此文首先使用TCGA简易下载工具下载乳腺癌的表达谱和临床随访信息。问句1：这是他的临床数据： ER PR在临床随访信息中...

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祝让飞发布于 2018-08-21 22:02

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文章解读：乳腺癌甲基化分型的TCGA公共数据挖掘文章思路解析

这是一篇发表在五分多的杂志上的纯生信的文章，思路清晰，数据获取简便，在其他的癌症的分析中可以套用。

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祝让飞发布于 2018-05-01 15:04

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就拿TCGA的乳腺癌RNA-seq数据来做个WGCNA示例吧

WGCNA（Weighted Correlation Network analysis）是一个基于基因表达数据，构建基因共表达网络的方法。WGCNA和差异基因分析（DEG）的差异在于DEG主要分析样本和样本之间的差异，而WGCNA主要分析的是基因和基因之间的关系。WGCNA通过分析基因之间的关联关系，将基因区分为多个模块。而最后通过这些模块和样本表型之间的关联性分析，寻找特定表型的分子特征。

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祝让飞发布于 2017-06-04 10:53